BIO 5100 Bitki Ekofizyolojisi Biyoloji Anabilim Dalı

Transkript

BIO 5100 Bitki Ekofizyolojisi
Biyoloji Anabilim Dalı
Dersin Dönemi / Düzeyi
Dersin Kodu ve Adı
Kredisi / ECTS Kredisi
Dersin Özelliği
Dersin Amacı ve Hedefi
Dersin İçeriği
Dersin Ön şartı / Öneriler
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin Öğretim Üyesi
Dersin web sayfası
İletişim
Bahar / Yüksek Lisans
BIO5100 Bitki Fizyolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
BIO 5101 Botanikte Araştırma Yöntemleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
İletişim
Güz / Yüksek Lisans
BIO5101 Botanikte Araştırma Yöntemleri
3.0 / 7.5
Zorunlu
Dersin amacı, öğrencinin öncelikle lisansüstü eğitimi
boyunca bilimsel makale ve tezlere ulaşma yöntemleri, tez
hazırlama ile ilgili bilgilerin ve botanik ile ilgili bazı
araştırmaların
yöntemlerinin verilmesidir.
Böylece
öğrencinin lisansüstü süresince botanik ile ilgili
çalışmalarda başarılı olması hedeflenmektedir.
Bilimsel makalelere ulaşma yöntemleri, bilimsel makale
incelerken dikkat edilecek hususlar, tez tarama, tez
hazırlama sırasında makalelerin değerlendirilmesi,
deneysel verilerin tez hazırlamak için istatistiksel olarak
değerlendirilmesi, bitkilerin toplanması, kurutulup saklama
yöntemleri (Herbaryum), bitki teşhis yöntemleri ve
teşhislerde flora kitaplarının kullanımı, polen preparatı
hazırlama yöntemleri, atmosferik polen araştırma
yöntemleri, balda polen analizi yöntemi, azot döngüsü ile
ilgili ekolojik çalışmalarda kullanılan yöntemler, Coğrafi
Bilgi Sistemleri (CBS) yönteminin tanıtılması.
Dersin ön şartı yoktur. Dersin amacına ve hedefine
ulaşabilmesi, öğrencinin başarılı olabilmesi için öğrencinin
bu dersin içeriğinde belirtilen kavramlar hakkında daha
önce lisans seviyesinde bilgiye sahip olmaları
gerekmektedir.
The Herbarium Handbook, L.Forman, D.Bridson,
Pollen Grains, RP Wodehuse,
Geographic Information Systems (Ed. David Martin),
Routledge London, New York.
Mineral Nutrition of Higher Plants (Ed. H. Marschner),
Academic Pres, London.
Bitki Ekolojisi Ders Notları (M Öztürk, M.Pirdal, F. Özdemir)
Ege Üniv. , Fen Fakültesi, İzmir.
Flora of Turkey and the East Aegean Islands, Vol. 1-10, PH
Davis (ed.)
Ders teorik olarak sunum şeklinde verilecektir.
Öğrencilerin derse katılımlarını sağlamak amacıyla dersler
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Yarıyıl Sonu Sınavı %100
Türkçe
Prof.Dr.Adem BIÇAKÇI
Doç.Dr.Hülya ARSLAN
Yrd.Doç.Dr.Gül TARIMCILAR
0 224 29 41789 / e-posta: [email protected]
BIO 5102 Aeropalinoloji
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO5102 Aeropalinoloji
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, öğrencinin havada bulunan polen ve sporları
tanımasıdır. Böylece öğrencinin duyarlı bireylerde allerjiye
yol açan polen ve sporları teşhis edebilecek seviyeye
gelmesi hedeflenmektedir.
Aeropalinolojinin tanımı, tarihçesi. Polen, spor üretimi ve
dağılımı. Atmosferik polen toplama ve tayin yöntemleri.
Polen takvimi hazırlama yöntemleri. Polinosis ve alerjiye
neden olan polenler. Polenlere karşı duyarlı bireyler için
tanı ve tedavi yöntemleri. Türkiye’de polen takvimi
çıkarılan bölgeler ve bu bölgelerde en fazla polene sahip
taksonlar.
Dersin ön şartı yoktur.
Aerobiology, RL Edmonds
Pollen Grains, RP Wodehouse
Türkiye’nin atmosferik polenleri, A Bıçakçı ve ark.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Türkçe
Prof. Dr. Adem BIÇAKÇI
--0 224 29 41789 / e-posta: [email protected]
BIO 5103 Bitki Sistematiği Ve Prensipleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5103 Bitki Sistematiği ve Prensipleri
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, öğrencinin lisans eğitimi boyunca görmüş
olduğu tüm sistematik derslerine ek olarak geliştirilmiş ve
ileri düzeyde taksonomik bilgiye sahip olmasıdır.
Genel Taksonomik Bilgiler,
Taksonomik problemler,
Taksonomik karakterler, Varyasyonlar, Taksonomide
kullanılan metod ve teknikler, Taksonomik Çalışmalar,
Yayınlama ve isimlendirme, Botanikte isimlendirme
kuralları.
gerekmektedir.
- Principles of Angiosperm Taxonomy, P. H. Davis, V.H.
Heywood, 1963
- Uluslar arası Botanik Adlandırma Yasası, A. Dönmez, 2006
- Botanical Latin, W.T. Stearn, 1986
- Molecular Systematics and Plant Evolution, Eds: P.M
Hollingsworth, R.M. Bateman, R.J. Gornal, 2004
- Taksonomi Yaz okulu Ders Notları, Ed: B. Çıplak, 1997
- Taksonomik Zoolojinin Prensip ve Metodları, İ. Yılmaz,
1997.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Prof. Dr. Hulusi MALYER
--0 224 29 41785, e-posta: [email protected]
BIO 5104 Etnobotanik
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5104 Etnobotanik
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, günümüz insan-bitki ilişkisinin yanı sıra,
günümüz bitkileri ve kullanım şekilleriyle arkeolojik bitki
kalıntıları ve kullanımları arasında karşılaştırmalı
çalışmalar yapmaktadır.
Etnobotaniğin tanımı, tarihçesi, gelişimi, çalışma teknikleri,
Etnobotanik ve Paleobotanikte kullanılan metod ve
yaklaşımlar, Bitkilerin yöresel, tıbbi ve gıda olarak
kullanımları, Bitkilerin el sanatlarında kullanımı…
gerekmektedir.
- Ethnobotany; A methods Manual, Garry J. Martin, 2004
- Ethnobotany; Principles and Applications, C.M. Cotton,
1996
- Türkiye’de Bitkiler İle Tedavi, T. Baytop, 1999
- Şifa Niyetine, E. Tuzlacı, 2002
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Prof. Dr. Hulusi MALYER
BIO 5105 Simbiozis
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5105 Simbiozis
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, lisans eğitimi boyunca görmüş olduğu ortak
yaşam konularının tam olarak pekiştirilmesi ve bitkilerdeki
ortak yaşam tiplerinden mutualizme en güzel örnek olan
likenlerin yapısına katılan alg ve mantarın birliktelikteki
fonksiyonları ve fizyolojilerinin detaylı olarak anlaşılması
hedeflenmektedir.
Başlıca simbiozis tipleri (parazitizm, kommensalizm,
mutualizm), fungal – bitki simbiozisi (Mycorrhizal), fungal –
alg simbiozisi (liken), Bitkilerde simbiozun başlangıcı,
gelişimi ve bitkiler açısından önemi, simbiozisin çoğrafik
dağılımı ve ekolojik önemi, liken simbiozisi; likenin yapısına
katılan alg (cyanobacter, yeşil alg) ve mantarın
(Ascomycota;
Discomycetes,
Pyrenomycetes;
Basidiomycota) genel özellikleri ve ortak yaşamdaki
fonksiyonları (fotosentez ve karbon metabolizması, azot
fiksasyonu, besin değişimi).
gerekmektedir.
Symbiosis: Mechanisms and Model Systems, J. Seckbach.
The Lichen Symbiosis, V. Ahmadjian,
Lichen Biology, Thomas H. Nash III
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Türkçe
Yrd.Doç. Dr. Şaban GÜVENÇ
BIO 5106 Türkiye Vejetasyon Coğrafyası
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Dersin Önşartı / Öneriler
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin Öğretim Üyeleri
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5106 Türkiye Vejetasyon Coğrafyası
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, Türkiye bitki örtüsünü oluşturan vejatasyon
formasyonlarının ve bitki birliklerinin öğretilmesi ve
günümüzdeki durumun tanıtımıdır.
Türkiye'de bitki örtüsünün ekolojik şartları, Türkiye'de
bitki örtüsünün geçirdiği evrim, Türkiye'nin flora ve
biyocoğrafya
bölgeleri,
Türkiye'nin
vejetasyon
formasyonları (kuzey Anadolu, Akdeniz, Orta Anadolu,
Doğu Anadolu, Güney Doğu Anadolu), bu formasyonları
oluşturan bitki birlikleri.
1. İbrahim Atalay, Türkiye’ nin Ekolojik Bölgeleri, Dokuz
Eylül Üniversitesi Yay.
2.İbrahim Atalay, Ekosistem Ekolojisi ve Coğrafyası; Cilt I,
Çev. Ve Orm. Bak..
3. İbrahim Atalay, Ekosistem Ekolojisi ve Coğrafyası; Cilt II,
META Basım.
4. A. Rıza Çetik, Türkiye Vejetasyonu: I. İç Anadolu’nun
Vejetasyonu ve Ekolojisi, Selçuk Üniversitesi.
5. Y. Akman, Türkiye Orman Vejetasyonu, Ankara
Teorik
Yarıyıl sonu sınavı
Türkçe
Prof. Dr. Gönül Kaynak
--0 224 29 41852/ [email protected]
BIO 5107 Ağır Metal Kirliliğinin Yüksek
Bitkilerle Islahı
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5107 Ağır Metal Kirliliğinin Yüksek Bitkilerle Islahı
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, çevre kirliliğinin giderilmesi konusunda
bitkilerin fonksiyonunun kavratılması ve bununla ilgili
yöntemlerin tanıtılmasıdır.
Bitkiler tarafından metal alınımı ve taşınımı. İndikatör,
Akümülatör ve Hiperakümülatör bitkiler. Bitkilerde metal
birikimini sağlayan mekanizmalar.
Hiperakümülatör
bitkilerde fitoşelatlar ve metallotiyoninler.
gerekmektedir.
Heavy metal Stres in Pants: From Biomolecules to
Ecosystems (Ed. MNV Prasad), Second Ed. Springer-Verlag
Berlinheidelberg 2004.
Mineral Nutrition of Higher Plants (Ed. H Marschner)
Academic Press., London. (1995)
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Doç. Dr. Hülya Arslan
BIO 5108 Likenlerin Tayini ve Prensipleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
İletişim
BIO 5108 Likenlerin Tayini ve Prensipleri
3.0 / 7.5
Seçmeli
olduğu, çiçeksiz bitkiler kapsamında ele alınan likenlerin
sistematik olarak incelenmesi ve tayini konusunda teorik ve
pratik bilgilerin aktarılması.
Liken tayininde kullanılan terminolojik tanımların açıklanması
ve bu özellikleri taşıyan, kabuksu, yapraksı ve dalsı görünümlü
likenler ile Lichenes Imperfecti grubunda yer alan çeşitli
likenlerin tayin edilmesi.
İncelenen likenlerin betimlemelerinin yapılması
ulaşabilmesi, öğrencinin başarılı olabilmesi için öğrencinin bu
dersin içeriğinde belirtilen kavramlar hakkında daha önce
lisans seviyesinde bilgiye sahip olmaları ve yüksek lisans ders
programında yer alan Likenoloji dersini alması uygundur.
Çok sayıda liken türü içeren ve bu türlere ait tayin anahtarları
yer alan temel liken kitaplarından yararlanılmaktadır.
*Clauzade, G. and Roux, C. (1985). Likenoj De Okcidenta
Eŭropo Ilustrita Determinlibro. - Bulletin de la Société
Botanique du Centre-Quest Nouvelle Série - Numéro Spécial:
7, Royan, France, 893 pp.
*Purvis, O.W., B.J. Coppins, D.L. Hawskworth, P.W. James and
D.M. Moore (1994). The Lichen Flora of Great Britain and
Ireland. The British Lichen Society Department of Botany, The
Natural History Museum, London. pp. 710.
*Wirth, V. (1995). Die Flechten Baden – Württembergs Teil 1,
2. Eugen Ulmer GmbH & Co., Stuttgart. pp. 1006.
* Nash III, T.H., Ryan, B.D., Diederich, P., Gries, C. and Bungartz,
F. (2004): Lichen Flora of the Greater Sonoran Desert Region.
Tepme, Arizona: Lichens Unlimited, Arizona State University,
Vol. 1, 2. pp. 532, 742.
* Nimis P.L. and Martellos S. (2004). Keys to the Lichens of
Italy I. Terricolous species. Edizioni Goliardiche, Trieste. pp.
341.
* Wasser, S. P. and Nevo E. (2005). Lichen-Forming,
Lichenicolous, and Allied Fungi of Israel. A.R.A. Gantner Verlag
K.-G. pp. 384.
Derse ait terminoloji teorik olarak sunum şeklinde
verilecektir. Liken türlerinin tayini öğrencilerle birlikte
uygulamalı
olarak
yapılacaktır.
Öğrencilerin
derse
katılımlarını sağlamak amacıyla kendilerinin arazide çeşitli
substratlardan topladıkları liken örnekleri de ders
kapsamında tayin edilecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Doç. Dr. Şule ÖZTÜRK
BIO 5109 Ekosistemlerde Verimlilik Tayinleri
Ve Değerlendirme Yöntemleri
Dersin Dönemi / Düzeyi Güz/ Yüksek Lisans
Dersin Kodu ve Adı BIO 5109 Ekosistemlerde Verimlilik Tayinleri Ve
Değerlendirme Yöntemleri
Kredisi / ECTS Kredisi 3.0 / 7.5
Dersin Özelliği Seçmeli
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5110 Bitki Tayini ve Değerlendirmesi II
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Bahar/ Yüksek Lisans
BIO 5110 Bitki Tayini ve Değerlendirmesi II
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, tür tayininde kullanılan terminoloji ve
Türkiye florası 5 - 9 ciltlerde yer alan familyalara ait bitki
tür tayinlerinin anahtarlar kullanılarak öğretilmesidir.
Dersin İçeriği Bitki
tayini ve yöntemleri; tanımlama anahtarları,
monograf ve floranın kullanımları – Türkiye Florası’nın 5
- 9 ciltlerinde yer alan familyalara ait bitki tür tayinlerinin
yapılması.
Dersin Ön şartı / Öneriler Dersin ön şartı yoktur.
Kaynaklar P.H. Davis, Flora of Turkey; Volum I, II, III, IV, Edinburgh.
A. Baytop, Botanik Kılavuzu, İ.Ü. Basımevi, İstanbul.
Öğretme Şekli Teorik ve Uygulama
Değerlendirme Yarıyıl Sonu Sınavı
Eğitim Dili Türkçe
Dersin Öğretim Üyesi Prof.Dr. Gönül Kaynak
Dersin web sayfası --İletişim 0 224 29 41852/ [email protected]
BIO 5111 Polen Morfolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO5111 Polen Morfolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, öğrencinin polenin oluşumu ve morfolojisi
hakkında bilgi sahibi olmasıdır. Böylece öğrencinin polen
morfolojisi çalışmaları ile bitki sistematiğinde karşılaşılan
problemlerin çözümüne katkıda bulunacak seviyeye
gelmesi hedeflenmektedir.
Palinolojinin tanımı ve bölümleri, polen teşhis alanları,
sporoderm,
ekzin
tabakalanması,
apertürler,
ornemantasyon, polen şekilleri ve tipleri, taksonomide
polen morfolojisinin önemi, Bazı Gymnosperm ve
Angiosperm polenlerinin morfolojik olarak incelenmesi,
polen preperatı hazırlama yöntemleri, polen duvarı
ontogenisi, tapetum ve orbiküller, heteromorf polenler
Pollen morphology and plant taxonomy (Angiosperms),
G.Erdtman
Textbook of pollen analysis, K.Faegri and J.Iversen
Polen morfolojisi ve Türkiye’nin önemli Gymnospermleri
üzerinde palinolojik araştırmalar, B.Aytuğ
Pollen Grains, RP Wodehouse,
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Türkçe
Prof.Dr.Adem BIÇAKÇI
BIO 5112 Peyzaj Ekolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
İlkbahar / Yüksek Lisans
BIO 5112 Peyzaj Ekolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı peyzajın unsurlarının ve peyzaj insan
ilişkilerinin tanıtılmasıdır.
Peyzaj ekolojisinin tanımı ve biyolojide hiyerarşi düzeni
kavramı ile ilişkisi, peyzajın unsurları, kommunite ve peyzaj
düzeyinde biyoçeşitlilik, Ada biyocoğrafyası kavramı,
Zaman ve mekân ölçeği, peyzaj geometrisi, sürdürülebilir
peyzaj kavramı, insan tasarımlı peyzajlar.
gerekmektedir.
Ekolojinin Temel İlkeleri (Ed: E. Odum, G. Baret; Çeviri Ed.
K. Işık), Palme Yayıncılık, Ankara, 2008.
Lerning Landscape Ecology (Ed: S.E. Gergel, M.G. Turner)
Springer-Verlag, New York, 2002.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Doç. Dr. Hülya Arslan
BIO 5113 Bitki Tayini ve Değerlendirmesi I
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
BIO 5113 Bitki Tayını ve Değerlendirmesi I
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, tür tayininde kullanılan terminoloji ve
Türkiye florası 1-4 ciltlerde yer alan familyalara ait bitki tür
tayinlerinin anahtarlar kullanılarak öğretilmesidir.
Dersin İçeriği
Bitki tayini ve yöntemleri; tanımlama anahtarları,
monograf ve floranın kullanımları – Türkiye Florası’nın
ilk 4 cildinde yer alan familyalara ait bitki tür tayinlerinin
yapılması.
Kaynaklar P.H. Davis, Flora of Turkey; Volum I, II, III, IV, Edinburgh.
A. Baytop, Botanik Kılavuzu, İ.Ü. Basımevi, İstanbul.
Öğretme Şekli Teorik ve Uygulama
Değerlendirme Yarıyıl Sonu Sınavı % 100
Dersin Öğretim Üyesi Prof. Dr. Gönül Kaynak
Dersin web sayfası --İletişim 0 224 29 41852/ [email protected]
BIO 5115 Likenoloji
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO5115 Likenoloji
3.0 / 5.0
Seçmeli
Lisans eğitiminde çiçeksiz bitkiler içinde yer alan likenler
hakkında ayrıntılı bilgi verilmesi, yüksek lisans çalışmasında
likenler ile çalışacak öğrencilere likenlerin özelliklerinin
anlatılması.
olduğu, çiçeksiz bitkiler kapsamında ele alınan likenlerin
morfolojik, anatomik, fizyolojik ve ekolojik özellikleri
hakkında bilgi verilmesi. Liken yapısına katılan mantarların ve
alglerin özelliklerinin vurgulanması. Likenlerin kullanım
alanlarının belirtilmesi.
ulaşabilmesi, öğrencinin başarılı olabilmesi için öğrencinin bu
dersin içeriğinde belirtilen kavramlar hakkında daha önce
lisans seviyesinde bilgiye sahip olmaları uygundur.
*Kershaw K.A. (1985). Physiological Ecology of Lichens
(Cambridge Studies in Ecology). Cambridge University Pres.
pp. 293.
*Clauzade, G. and Roux, C. (1985): Likenoj De Okcidenta
Eŭropo Ilustrita Determinlibro. - Bulletin de la Société
Botanique du Centre-Quest Nouvelle Série - Numéro Spécial: 7,
Royan, France. pp.893.
*Ahmadjian V. (1993). The Lichen Symbiosis. Jonh Wiley &
Sons, Inc., USA. pp. 250.
*Purvis, O.W., B.J. Coppins, D.L. Hawskworth, P.W. James and
D.M. Moore. 1994. The Lichen Flora of Great Britain and
Ireland. The British Lichen Society Department of Botany, The
Natural History Museum, London. pp. 710.
*Wirth, V. 1995. Die Flechten Baden – Württembergs Teil 1, 2.
Eugen Ulmer GmbH & Co., Stuttgart. pp. 1006.
*Nash III T.H. (1996). Lichen Biology. Cambridge University
Pres. pp. 303.
*Nash III, T.H., Ryan, B.D., Diederich, P., Gries, C. and Bungartz,
F. (2004): Lichen Flora of the Greater Sonoran Desert Region.
Tepme, Arizona: Lichens Unlimited, Arizona State University,
Vol. 1, 2. pp. 532, 742.
Ders teorik olarak sunum şeklinde verilecektir. Öğrencilerin
derse katılımlarını sağlamak amacıyla dersler seminer
şeklinde tartışma ortamı yaratılarak sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Doç. Dr. Şule ÖZTÜRK
BIO 5200 Mantarlar ve Küfler; Biyolojileri ve
Kullanımı
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5200 Mantarlar ve Küfler; Biyolojileri ve Kullanımı
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, Mantar grubu organizmaların biyolojik
önemleri, taksonomi, morfolojik, sitolojik, metabolik
özellikleri yanısıra biosentez ve fermentation özellikleri
bioteknolojik kullanımları, biodegradation, bioremedation
işlev ve özellikleri, Gıda bozulmasında rolleri, ve substrat
kullanımı ve etkileşimlerine yönelik bilgi aktarımı
gerçekleştirmektedir.
Mantar Alemine genel bakış.
Mantar Ekoloji ve mantarlardan faydalanma olanakları,
Küfler ve ilgili toksinler ve biyolojik zararları,
Küf bulaşı yolları ve ilişkin substrat materyaller,
Gıdalarda
küf
gelişiminin
baskılanması
ve
kontaminasyonun engellenmesi.
Dersin ön şartı yoktur. Ders içeriğinin daha iyi kavranması
ve bellenmesi için alt bilgiye sahip olunması önerilir.
-Fundamental of the Fungi, E. Moore-Landecker, Prentice
Hall Upper saddle River, N.J. U.S.A. 1996
-Microbiyal Ecology, R. M. Atlas, R. Bartha, Addison Wesley
Longman, 1997
-Küf-Gıda-İnsan, İ. Şahin, M. Korukluoğlu. Vipaş AŞ., Bursa
2000
-Gıda Mikrobiyolojisi, A. Ünlütürk, F. Turantaş, İzmir 2003
-Fungal Biology, J. Deacon, Blackwell Publishing, 4th
Edition, 2006
Ders teorik olarak verilecektir. Öğrencilerin derse
katılımlarını sağlamak amacıyla derslerde tartışma ortamı
yaratılacaktır. Uygulama amaçlı laboratuar çalışmalarına
yer verilecek ve teknik geziler düzenlenecektir.
Ödev %50
Türkçe
Doç. Dr. C.Cem ERGÜL
--0 224 2941781/ e-posta: [email protected]
BIO 5201 İLERİ BİYOMETRİ
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
BIO 5201/İLERİ BİYOMETRİ
3.0 / 5.0
Zorunlu
Biyolojik çalışmalarda veriler toplanır. Bu verilerin
yayınlarda kullanılabilmesi için istatistik değerlendirilmesi
gerekmektedir. Bu derste biyolojik verilerin istatistik
değerlendirilmesinde yaygın olarak kullanılan analiz
yöntemlerinin öğretilmesi amaçlanmıştır. Dersin sonunda
öğrencilerin
bağımsız
şekilde
verileri
istatistik
değerlendirebilmeleri hedeflenmiştir.
Varyans Analizi, çok faktörlü varyans analizleri,
ortalamaların karşılaştırılması, non-parametrik testler,
poisson dağılımı, binomial dağılım, regresyon, multipli
regresyon, regresyon eşitliklerinin karşılaştırılması,
korelasyon, küme analizi.
Dersin Ön şartı / Öneriler Dersin ön şartı yoktur. Lisans düzeyindeki temel matematik
bilgisi yeterlidir.
Kaynaklar 1. J.H. Zarr Biyostatistical Analysis, Prentice Hall Int. Inc.
2. R. R. Sokal, FJ. Rohlf, Biometri, W. H. Freeman and
Company.
Öğretme Şekli Ders teorik olarak sunum şeklinde verilecektir. Konu ile
ilgili ödevler yapılacaktır.
Değerlendirme Ödev %25, Yarıyıl Sonu Sınavı %75
Dersin Öğretim Üyesi Prof. Dr. Rahmi BİLALOĞLU, Yrd. Doç. Dr. Serap Çelikler
Dersin web sayfası --İletişim 0 224 29 41783 / e-posta: [email protected]
BIO 5202 Genetik Analizin Temel İlkeleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
BİO 5202/GENETİK ANALİZİN TEMEL İLKELERİ
3.0 / 7.5
Seçmeli
Bu derste genetik analizin temel ilkeleri üzerinde
durulacaktır. Genetik araştırmalarda temel teşkil edecek
mutasyon, komplementasyon, supresyon ve kombinasyon
gibi analiz yöntemleri üzerinde durulacak, örnek analizlerle
konuların kavratılmasına çalışılacaktır.
Mutasyonlar, mutant seçimi ve karekterizasyonu,
komplementasyon testi, epistasi ve supresyon, genlerin
işlevlerinin analizi, reverz genetik, epigenetik, mayotik
rekombinasyon, genetik harita yapımı
Dersin Ön şartı / Öneriler Dersin ön şartı yoktur. Lisans düzeyindeki temel genetik
kavramları bilmeleri gerekir.
Kaynaklar 1. R.S Hawleyy and M. Y Walker, Advanced Genetic Analysis,
Blackwell Publishing, 2003.
2. R.J. Greenspan, Fly Pushing, The Theory and Practice of
Drosophila Genetics. Cold Spring Harbor LAboratory Pres.
2004.
Öğretme Şekli Ders teorik olarak sunum şeklinde verilecektir.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir. Makale sunumları yapılacaktır.
Değerlendirme Ödev %25, Yarıyıl Sonu Sınavı %75
Dersin Öğretim Üyesi Prof. Dr. Rahmi BİLALOĞLU, Yrd. Doç. Dr. Serap Çelikler
BIO 5203 Mikrobiyal Ekoloji
Dönemi / Düzeyi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
BIO 5203 Mikrobiyal Ekoloji
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, öğrencilerin çevrelerindeki mikro habitatlar
içerisindeki aktiviteleri ve önemlerini anlama ve kavramaları,
mikrobiyal fizyoloji ve ekoloji çerçevesinde mikroçevrede etkin
abiyotik
ve
biyotik
parametrelerin
değerlendirilmesi,
mikroorganizmalardan yararlanma ve doğal ortamlarının
korunmalarına yönelik bilgi sunulması hedeflenmektedir.
Dersin İçeriği Mikrobiyal Ekoloji ve Tarihsel Gelişimi,
Mikrobiyal Evrim ve Biyoçeşitlilik,
Mikrobiyal Populasyonlar arasındaki etkileşimler,
Bitkiler, Hayvanlar ve Mikroorganizmalar arasındaki etkileşimler,
Mikrobiyal Komunitelerin Gelişimi,
Mikroorganizmaların çevre koşullarına adaptasyonları,
Hava, su ve toprak mikrobiyolojisi,
Biyokimyasal Döngüler(Karbon, Hidrojen, Oksijen, Azot,Kükürt,
Fosfor, Demir ve diğer döngüler),
Mikrobiyal Ekolojide Biyoteknolojik Yaklaşımlar.
Dersin Ön şartı / Dersin ön şartı yoktur. Ders içeriğinin daha iyi kavranması ve
Öneriler bellenmesinde alt bilgiye sahip olunması önerilir.
Kaynaklar -Fungal Ecology, N.J. Dix, J. Webster, Chapman & Hall 1995
-Microbiyal Ecology, R. M. Atlas, R. Bartha Addison Wesley
Longman, 1997
-Biodiversity of Fungi. G. M. Mueller. G.F. Bills. M.S. Foster
Elsevier Academic Press. 2004
-Çevre Mikrobiyolojisi, 2. Baskı, . Özçelik, SDÜ Ziraat
Fakültesi, 2004
-Brock Biology of Microorganisms, Madigan, Martinko NJ.
Pearson Prentice Hall 2006
-Genel Mikrobiyoloji, 3. Baskı S. Özçelik, SDÜ Ziraat Fakültesi,
2009
Öğretme Şekli Ders teorik olarak verilecektir. Öğrencilerin derse katılımlarını
sağlamak amacıyla derslerde tartışma ortamı yaratılacak, uygun
zamanlarda arazi ve laboratuar çalışmaları yapılacaktır.
Değerlendirme Ödev %50
Dersin Öğretim Üyesi Doç. Dr. C.Cem ERGÜL
Dersin web sayfası --İletişim 0 224 2941781/ e-posta: [email protected]
BIO 5204 Kromozom Yapı ve Fonksiyonları
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bahar / Yüksek lisans
BIO 5204 Kromozom Yapı ve Fonksiyonları
3.0 / 7.5
Seçmeli
Bu dersin amacı, ökaryotik kromozom yapısı, bileşenleri ve
paketlenmesi hakkında bilgi vermektir.
Ökaryotik Kromatin yapısı, bileşenleri ve kromozom
paketlenmesi, Histon modifikasyonları, metilasyon,
fosforilasyon, asetilasyon, deasetilasyon, ubikuitinasyon vs.,
Histon modifikasyon enzimleri, Histon Kodu Hipotezi,
Histon İnteraksiyonları ve konformasyonları, Histon
domainleri, Histon varyantları, Nonhiston proteinler ve
yapısı, Sentromer ve telomerin moleküler yapısı,
Eukromatin- heterokromatin formu, Gen aktivasyonu ve
susturulması
1. Lodish H, Berk A, Zipursky SL et al. (2000) Molecular Cell
Biology, 4th edn. New York: WH Freeman.
2. Hartwell L, Hood L, Goldberg ML et al. (2000) Genetics:
from Genes to Genomes. Boston: McGraw Hill.
3. Human Chromosomes, Eeva Therman, Orlando Miller,
Springer.
Teorik sunum, Seminer
Ödev %40, Yarıyıl sonu sınavı %60
Türkçe
Yrd. Doç. Dr. Serap ÇELİKLER
Doç. Dr. Nilüfer ÇİNKILIÇ
--0 224 29 41796 / [email protected]
0 224 29 41797/ [email protected]
BIO 5205 Sistematik Mikoloji
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO5205 Sistematik Mikoloji
3.0 / 7.5
Seçmeli
Fungal organizmaların biyolojik ve ekolojik önemleri,
taksonomik pozisyonları, fungusların morfolojik, sitolojik,
metabolik
özellikleri,
biosynthesis,
fermentation,
biotechnological,
biodegradation,
bioremedation
aktiviteleri ve kullanım olanakları, parazitik, simbiyotik
etkileri ve ilişkilerine yönelik bilgi aktarımını
gerçekleştirmek dersin birincil amacıdır.
Fungal Aleme genel bakış (Sitolojik, Morfolojik, Fizyolojik,
Ekolojik),Fungusların taksonomik yeri ve sınıflandırılması,
Gymnomycota
bölümü
ve
bağlı
taksonların
tanıtımı,Mastigomycota bölümü ve bağlı taksonların
tanıtımı,Amastigomycota bölümü ve bağlı taksonların
tanıtımı, Fungal Fizyoloji, Fungal Ekoloji ve Funguslardan
faydalanma olanakları.
Dersin ön şartı yoktur. Ders içeriğinin daha iyi kavranması
ve bellenmesinde alt bilgiye sahip olunması önerilir.
-Fundamental of the Fungi, E. Moore-Landecker, Prentice
Hall Upper saddle River, N.J. U.S.A. 1996
-Fungal Biology, D. H. Jenings, G. Lysek, Bios Scientific Publ.
Germany. 1996
-Biodiversity of Fungi, G. M. Mueller. G.F. Bills. M.S. Foster
Elsevier Academic Press. 2004
Ders teorik olarak verilecektir. Derse katılım sağlamak
amacıyla tartışma ortamı yaratılacaktır. Uygun zamanlarda
arazi çalışmaları ile uygulamalara gerçekleştirilecektir.
Ödev %50
Türkçe
BIO 5206 EKOGENETİK
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BİO 5206/EKOGENETİK
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, gen-çevre ilişkisini belirleyerek polimorfik
genlerin insanlar için nasıl sorun oluşturduğunun
anlaşılmasını sağlamak
Genetik yatkınlığın tanımı, genetik yatkınlık ve iş ile ilgili
hastalıklar, çevresel toksik ajanlara genetik yatkınlık,
yaygın hastalıklara genetik yatkınlık, genetik yatkınlıkla
ilgili deneysel kanıtlar, hayvan deneyleri, cinsiyete bağlı
genetik yatkınlık farklılıkları, farmakogenetik, alkol ve
aldehit metabolizmasındaki farklılıklar, DNA metilleyici
ajanlara genetik yatkınlık, hastalıklara genetik yatkınlığın
etik değerlendirmesi.
gerekmektedir.
1.Ecological Genetics: Design, Analysis, and Application
Andrew Lowe, Stephen Harris, Paul Ashton, WileyBlackwell.
2. Gene-Environment Interactions: Fundamentals of
Ecogenetics
Lucio G. Costa (Editor), David L. Eaton (Editor), WileyBlackwell.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Türkçe
Doç. Dr. Nilüfer Çinkılıç
BIO 5207 Myxomycetes Tayini ve Prensipleri
Dönemi / Düzeyi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Ön şartı / Öneriler
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO5207 Myxomycetes Tayini ve Prensipleri
3.0 / 5.0
Seçmeli
Myxomycetes
grubu
organizmaların
teşhis,tanım
ve
preparasyonlarına yönelik bilgi sunulması hedeflenmektedir.
Myxomyceteslerin Genel Morfolojisi, Taksonomi ve Yaşam
Döngüsü, Fizyoloji, laboratuar kültürü, Ekoloji ve Coğrafik Dağılım,
Koleksiyon ve Saklanma Yöntemleri, Taksonomik işlemler ve Tayin
Anahtarlarının Kullanması.
-The Myxomycetes, G.W. Martin, C.J. Alexopoulos, University of
Iowa Pres, 1969
-Flora Neotropica, Myxomycetes, M.L. Farr, Monograph No:16, The
New York Botanical Garden, 1976
-A Guide To Temperate Myxomycetes, N.E. Nannenga- Bremekamp,
Biopress Limited, 1991
-Myxomycetes, A Handbook of Slime Moulds, S.L. Stephenson, H.
Stempen, Timber Press, 1994
Ders teorik olarak verilecektir. Uygun zamanlarda arazi ve
laboratuar çalışmaları yapılacaktır.
Uygulama Ödevi %50
Yarıyıl Sonu Sınavı %50 (%25 pratik,%25 teorik)
Türkçe
BIO 5208 Kök Hücre Biyolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5208 Kök Hücre Biyolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
Canlı vücudunda uzun süre bölünebilen, kendini
yenileyen ve aynı zamanda vücudun ihtiyacına göre
farklılaşarak diğer doku hücrelerine dönüşebilen hücreler
‘‘kök hücreler’’ olarak bilinmektedir. Bu dersin amacı
öğrencinin kök hücre biyolojisi ve güncel uygulamaları
hakkında lisans üst düzeyde bilgi sahibi olmasıdır.
Kök hücre tanımı, kök hücre araştırmalarının tarihçesi, kök
hücre kaynakları, kök hücrelerin kullanım alanları, kök
hücre biyolojisindeki gelişmeler, kök hücre kullanımındaki
etik, ekonomik ve sosyal konular.
Öğrencinin lisans seviyesinde hücre biyolojisi bilgisine
sahip olması gerekmektedir.
1. R. Lanza, J. Gearhart, B. Hogan, D. Melton, R. Pederson,
E.D. Thomas, J.Thomson, I. Wilmut. Essentials of Stem Cell
Biology. Academic Press.
Teorik sunum, Soru-cevap, Seminer
Ara sınav %50, Yarıyıl sonu sınavı %50
Türkçe
Doç. Dr. Tolga ÇAVAŞ
--0 224 29 41869 / [email protected]
BIO5209 ONKOGENLER VE KARSİNOGENEZ
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5209/ONKOGENLER VE KARSİNOGENEZ
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, Kansere sebep olan genleri tanımlamak ve
etkilerini anlatmak, kanserleşme sürecini anlamak.
Onkogenler, tanımları sınıflandırılması, hücre siklusuna
etkileri, kanserleşmeye etkileri, onkoproteinler, tümör
baskılayıcı genler, sınıflandırılmaları, kanser oluşumuna
etkileri, kanserleşmenin çok basamaklı yapısı, tümör
gelişimi, metastaz, tümör gelişim örneği kolon kanseri,
kanserin çevresel sebepleri.
gerekmektedir.
Molecular Carcinogenesis and the Molecular Biology of
Human Cancer, David Warshawsky; Joseph R. Landolph Jr.
Taylor and Francis
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Türkçe
Doç. Dr. Nilüfer Çinkılıç
BIO 5210 Moleküler Toksikoloji
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5210 Moleküler Toksikoloji
3.0 / 7.5
Seçmeli
Bu dersin amacı, toksikolojinin temel yönlerini, toksikolojik
süreçlerin
derinliğini
moleküler
bir
yaklaşımla
irdelemektir. Önemli moleküler toksikolojik konular
hakkında bilgi vererek öğrencilerin bu konular hakkında
araştırma perspektiflerini geliştirmek dersin ana hedefidir.
Toksikantların alımıve atılım mekanizması, Biyolojik makro
moleküllerle Xenobiyotik metabolik aktivasyonu ve adduct
oluşumu, Oksidatif stress ve hücre fonksiyonu ve
onkogenler üzerine etkisi, Moleküler toxicology teknikleri,
Nükleik asit adduct oluşumu ve gen aktivasyonu,
Toksikantların bioaktivasyonu, Ağır metal toksisitesi,
Kimyasal ve Biyolojik reaktif ara ürünler, Hastalıkların ve
İlaç toksisite rekasiyonlarının moleküler temelleri
1.Principles of Biochemical Toxicology, J. Timbrell
2. Introduction to Drug Metabolism, G. Gibson.
3. Konu ile ilgili literatürler
Teorik sunum, Seminer
Ödev %40, Yarıyıl sonu sınavı %60
Türkçe
--0 224 29 41796 / [email protected]
BIO 5211 Ekotoksikoloji
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5211 Ekotoksikoloji
3.0 / 7.5
Seçmeli
Ekotoksikoloji, kirleticilerin canlılar üzerindeki etkilerini
inceleyen bir bilim dalıdır. Bu ders kapsamında
ekotoksikoloji ile ilgili temel bilgilerin sunularak, bu alanda
uygulamalı araştırma çalışmalarından örnekler verilmesi
amaçlanmaktadır. Böylece öğrencinin çevre toksikolojisi ve
konunun güncel durumu ve lisansüstü çalışmalarında
kullanmak üzere gerekli temelin öğrenciye kazandırılması
hedeflenmektedir.
Toksokoloji kavramı ve ekoloji ile olan ilişkileri. Toksik
nitelikli kirleticilerin kaynaklarına ve yapılarına göre
sınıflandırılması. Toksik kirleticilerin vücuda alınma yolları.
Kirleticilerin biyosfer üzerindeki etkilerinin moleküler
düzeyden (metabolizma ve detoksifiksayon) organizma
(hedef organlar) ve ekosistem (türlerin yaşayabilirliği)
düzeyine varan ölçekteki etkilerinin incelenmesi. Toksik
etkilerin regulasyonu ve ekosistemin korunmasına yönelik
alinabilecek önlemler.
Dersin amacına ve hedefine ulaşabilmesi, öğrencinin
başarılı olabilmesi için öğrencinin bu dersin içeriğinde
belirtilen kavramlar hakkında daha önce lisans seviyesinde
bilgiye sahip olmaları gerekmektedir.
1. C.H. Walker, S.P. Hopkin, R.M.Sibly, D.B. Peakal..
Principles of Ecotoxicology. CRC Pres.
2. M.C. Newman, W.H. Clements. Ecotoxicology, A
comprehensive Treatment. CRC Pres.
Teorik sunum, Soru-cevap, Seminer
Türkçe
Doç. Dr. Tolga ÇAVAŞ
--0 224 29 41869 / [email protected]
BIO 5213 Serbest Radikal Biyolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5213 Serbest Radikal Biyolojisi
3.0 / 5.0
Seçmeli
Dersin amacı, Serbest radikallerin tanımı yapılarak türleri,
kaynakları ve biyolojik sistemler üzerine olan etkileri ayrıca
bunların zararlı etkilerini ortadan kaldırmaya yönelik
mekanizmaları ortaya koymaktır.
Reaktif oksijen türleri (ROS), serbest radikaller, oksijen ve
nitrojen radikalleri, radikal olmayan türler. Oksidatif stres.
Lipitlerin peroksidasyonu. Oksidatif DNA hasarları ve
onarım enzimleri. Antioksidanlar: in vivo ve in vitro
antioksidan mekanizması, enzimatik antioksidanlar, nonenzimatik koruma, doğal antioksidanlar ve kaynakları, yapıetki ilişkileri. Vitamin E. Vitamin C. Karotenoitler.
Polifenoller ve Flavonoitler. Beslenme ve antioksidanlar.
Yaşlanma ve Hastalıklarla antioksidanların ilişkisi.
Antioksidan ölçüm teknikleri.
gerekmektedir.
1. Free Radicals in Biology and Medicine, Barry Halliwell &
John M.C. Gutteridge.
2.Free Radicals, Oxidative Stress, and Antioxidants, Tomris
Özben.
3.Oxidative Stress Biomarkers and Antioxidant Protocols.
4.Konu ile ilgili literatürler.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Odev %40
Türkçe
BIO 5300 Fikolojide Biyokimyasal Yaklaşımlar
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5300 Fikolojide Biyokimyasal Yaklaşımlar
3.0 / 7.5
Seçmeli
olduğu derslerde fikoloji ile ilgili temel kavramları
öğrenmiş olması. Öğrencinin lisansüstü çalışmalarda ise
biyokimyasal sonuçları fikoloji ile ilişkendirebilme ve
yorumlamada başarılı olması hedeflenmektedir.
Su örneği alma, sayım ve tanımlama yöntemleri, Biyomas
ölçümleri,
Protein
tanımlaması
ve
analizi,
Spektrofotometrik ve florometrik klorofil analizi, Çözünmüş
oksijen analizi, Pigment analizi, Sekonder karotenoit analizi,
Kahverengi alglerden alginik asit ekstraksiyonu.
gerekmektedir.
Mark M.LİTTER and Diane S. LİTTER Handbook of
Phycological Methods, Cambride University Pres.
laboratuarda öğrenciye deney yaptırılarak işlenecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Prof. Dr. Şükran DERE
--0 224 29 41786/ e-posta: [email protected]
BIO 5301 Ötrofikasyon ve Kirlenme
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bio 5301 Ötrofikasyon ve Kirlenme
3.0 / 7.5
Zorunlu
olduğu derslerde su ekosistemlerinde ötrofikasyon ve
kirlenme ile ilgili temel kavramları öğrenmiş olması.
Öğrencinin lisansüstü çalışmalarında ise öğrenmiş olduğu
temel kavramları birbirleri ile ilişkilendirme konusunda
başarılı olması hedeflenmektedir.
Kirlenme, Organik kirlilik ve kirliliğin arıtımı, ötrofikasyon,
ötrofikasyona neden olan etmenler ve kontrolü. Ağır
metaller, asidifikasyon, toksik kirletici tipleri, termal
kirlilik, yağ kirliliği, radyoaktif kirlenme ve etkileri. Su
kaynaklarının yönetimi, biyolojik açıdan su kalitesini
belirleme yöntemleri.
gerekmektedir.
C.F.Mason Longman Scientific Tecnical,Longman Group UK
Limited 1981,1991
Edwards,R.W Schweiz.Z.Hydrol.,37,135-143,1975
Edwards,R.W Plannig and Ecology, 57-79,1984
Edwards,R.W Ecological assesment of environmental
gegradation,pollution and recovery,159-194.1989
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
BIO 5302 Ekonomik Algler ve
Değerlendirilmesi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bio 5302 Ekonomik Algler ve Değerlendirilmesi
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, öğrencinin alglerin ticari amaçla hangi
alanlarda kullanılabileceğini öğrenmesidir. Öğrencinin
bilim ve sanayi arasındaki işbirliğine katkı sağlayacak yeni
fikirler üretebilmesi hedeflenmektedir.
Ekonomik açıdan önemli olan alg türleri, bu alglerden ticari
amaçla izole edilen bileşikler ve moleküler özellikleri, tıpta,
eczacılıkta, gıda, tekstil, gübre, inşaat ve diğer sanayi
dallarında alglerin kullanım alanları.
gerekmektedir.
Christopher S. Lobban, David J. Chapman, Bruno P. Kremer.
1988. Experimental Phycology a Laboratuary Manual.
Fingerman M., Nagabhushanam R. (Ed) 2003. Recent
Advances in Marine Biotechnology.
Round F.E. 1981. The Biology of Algae, Cambridge
University Press. 654p.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
BİO 5303 Limnolojik Analizler
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5303 Limnolojik Analizler
3.0 / 7.5
Seçmeli
olduğu derslerde tatlısu biyolojisi ile ilgili temel
kavramların öğrenmiş olması. Öğrencinin lisansüstü
çalışmalarda ise yapılacak farklı analizlerle fiziksel,kimyasal
ve biyolojik parametreler arasında bağlantı kurması ve
Göl Havzasının Karakteristikleri ve Morfometresi, Fiziksel
karakteristikleri, Göl morfometresi, Çözünmüş oksijen
tayini, Spektrofotometrik pigment analizi, Fitoplankton
Biyoması ve Kompozisyonu, Perifiton komunitelerinde
Limnolojik araştırma metodları, Göllerde Bentik Fauna
gerekmektedir.
Robert G. WETZEL, Gene E. LİKENS. Limnological Analyses.
Second Edition. Springer-Verlag.
Mark M.LİTTER and Diane S. LİTTER Handbook Of
Phycological Methods.
laboratuarda deney ortamı yaratılarak sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Prf. Dr. Şükran DERE
BIO 5304 Alg Kültürü ve Fitoplankton Ekolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bio 5304 Alg Kültürü ve Fitoplankton Ekolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
olduğu derslerde Fitoplankton ile ilgili temel kavramların
öğrenmiş olması. Öğrencinin lisansüstü çalışmalarda Alg
kültürü için gerekli kavramları çözmede başarılı olması
hedeflenmektedir.
Fitoplankton büyümesine etki eden faktörler: Işık, Sıcaklık,
Tuzluluk, Termal tabakalaşma, termal tabakalaşmanın
fitoplanktonlar üzerine etkileri, Nütrientler, Alg kültür
ortamları.
gerekmektedir.
W.Marshall Darley.Algal Biology:a physiological approach.
Blackwell Scientific Publications.
Lobban C.S., Harrison P.J. Seaweed Ecology and Physiology.
Cambridge University Press.
Barsanti L., Gualtieri P. 2002. Algae Anatomy, Biochemistry
and Biotechnology. Taylor and Francis Group.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
BIO 5400 Karbohidrat Biyokimyası
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5400 Karbohidrat Biyokimyası
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, öğrencinin enerji ve Karbohidrat
metabolizmasını kavrayarak, biyokimyasal çevrimler
hakkında ilişki kurabilmesini sağlamaktır. Böylece
öğrencinin lisansüstü çalışmalarda yaptığı deneylerde elde
ettiği sonuçları, daha iyi değerlendirmesi hedeflenmektedir
Karbohidratların Sindirimi, emilimi, glikoliz, glikoneogenez,
TCA, Anaplerotik tepkimeler, Glioksalat siklusu, Pentoz
fosfat yolu, Solunumda enerji verimi, Mitokondri ve ETS, ER
ve ETS, Glikojenez Glikojenoliz, Üronik asit yolu ve C-vit
sentezi, Karbohidrat metabolizması düzenleyicileri,
Metabolizma bozuklukları.
Dersin ön şartı yoktur. Dersin amacına ulaşabilmesi için
temel biyokimya derslerinde anlatılan kavramlar hakkında
lisans seviyesinde bilgi sahibi olmaları gerekmektedir.
Principles of Biochemistry, Lehninger, Nelson and Cox
Principles of Biochemistry, Geoffrey Zubay
Biochemistry, Mathews van Holde
Biochemistry, Thomas M. Devlin
Ders teorik olarak anlatılarak tepkimeler bilgisayar
ortamında şekil, grafik ve animasyonlarla desteklenecektir.
Öğrencilerin derse katılımlarını sağlamak amacıyla, günlük
hayatta karşılaşılan sağlık sorunlarından örnekler verilerek
tartışma ortamı sağlanacaktır.
Ara sınav %30
Ödev ve Tartışma %20
Türkçe
Yrd. Doç. Dr. Egemen DERE
BIO 5401 Hücre Moleküler Biyolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BİO5401 Hücre Moleküler Biyolojisi
3.0 / 7.5
Zorunlu
Tüm canlı organizmaların temel birimi hücredir. Hücrelerin
yapısal özelliklerinin anlaşılması canlı sistemlerdeki
metabolik
olayların
biyokimyasal
prensiplerinin
anlaşılmasına temel oluşturur. Hücreyi oluşturan yapısal
birimlerin ve bu yapıların hücredeki işlevlerinin öğretilmesi
bu dersin başlıca hedefidir.
Hücre zarı yapısal özellikleri ve fonksiyonları, Hücreye
makromolekülerin alınması, hücrelerarası etkileşim ve
sinyal iletimi, Hücre iskeleti ve hücre içi transport,
organellerin özellikleri ve metabolizmadaki önemleri, hücre
bölünmesi,
hücre
çevriminin
kontrolü,
hücre
farklılaşmasının ve doku oluşumunun moleküler analizi.
1. B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P.
Walter. Molecular Biology of the Cell. 4. Ed. Garland Science
2. H. Lodish, A. Berk, S.L. Zipursky, P. Matsudaira, D.
Baltimore, J. Darnell. Molecular Cell Biology. W. H. Freeman
and Co.
3. Cell., Journal of Cell Biology., Molecular and Cellular
Biology adlı dergiler
Teorik sunum ve tartışma, ders içeriğine uygun güncel
konularda öğrencilerin makale sunumu
Türkçe
Prof.Dr. Sezai Türkel
--0 224 294 1782 / [email protected]
BIO 5402 Biyolojide Doku Ve Hücre Kültürü
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BİO5402 Biyolojide Doku Ve Hücre Kültürü
3.0 / 7.5
Seçmeli
BIO 5403 Enzimlerin Etki Mekanizması
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5403 Enzimlerin Etki Mekanizması
3.0 / 7.5
Seçimli
Dersin amacı, biyokimyasal tepkimeleri katalizleyen
enzimlerin daha iyi tanınmasını sağlayarak, öğrencinin
lisans eğitiminde öğrenmiş olduğu enzimlerin, çalışma
mekanizmasını kavratmaktır. Böylece öğrencinin lisansüstü
araştırmalarında yaptığı deneysel çalışmalarda, elde ettiği
verileri değerlendirmede, karşılaşabileceği problemlere
karşı daha başarılı yorumlar yapabilmesi hedeflenmektedir.
Enzim Yapısı ve kimyasal bağlar, Biyokimyasal tepkime
mekanizmaları, Moleküler birleşmelerin ilkeleri, Hücresel
kovalent bağlanma ve kırılmalar, Enzim Aktivitesi ve
aktivitesini etkileyen faktörler, Allosterik enzimler ve
Özellikleri (MWC ve KNF modelleri), Biyoenerjetik – kataliz
ve kinetiğe giriş, Aktif Bölge yapısının incelenmesi, Kataliz
Mekanizmaları (Asit-baz katalizi, elektrostatik kataliz,
Kovalent kataliz, Enzim Katalizi), Kofaktörü olmayan
Enzimlerin Kataliz Mekanizmaları, Metaloenzimlerde
kataliz, Enzim tepkimelerinde koenzimlerin rolü, Tek alt
birimli çok substratlı enzimler, Çok alt birimli enzimler
ulaşabilmesi için, öğrencinin bu dersin içeriğinde belirtilen
kavramları lisans seviyesinde almış olduğu derslerde
öğrenmiş olması gerekmektedir.
Enzymes, Trevor Palmer
Ders teorik olarak anlatılarak enzim modelleri bilgisayar
ortamında şekil, grafik, resim ve animasyonlarla
desteklenecektir. Öğrencilerin derse katılımlarını sağlamak
amacıyla ders, soru cevap şekline getirilerek tartışma
ortamı sağlanacaktır.
Ara sınav %30
Türkçe
BIO 5404 Gen Moleküler Biyolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BİO5404 Gen Moleküler Biyolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı farklı organizma guruplarında genlerin
yapısal özellikleri ve işleyiş prensiplerinin öğretilmesidir.
Prokaryot ve eukaryotlarda genlerin yapısal özellikleri,
prokaryot ve eukaryotlarda kromatin organizasyonu ve
genlerin işleyişine etkilerinin analizi, transkripsiyon, RNA
kesimi, translasyonun ve translasyon sonrası kontrol
mekanizmaları, değişik organizma guruplarında gen
işleyişinin kontrol mekanizmaları.
1. J.D. Watson, T.A. Baker, S.P. Bell, A. Gann, M. Levine, R.
Losick. Molecular Biology of the Gene. CSHL Pres.
2. B. Lewin. Genes IX. Jones and Bartlett Publishers.
Teorik sunum, Gen Moleküler Biyolojisi ile ilgili konularda
öğrencilerin makale sunumu.
Türkçe
Prof. Dr. Sezai Türkel
--0 224 294 1782 / [email protected]
BIO 5405 Protein Biyokimyası
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO5405 Protein Biyokimyası
3.0 / 7.5
Seçimli
Dersin amacı, öğrenciye proteinlerin metabolik önemleri
kavratılarak, biyolojik sistemlerde görev yapan bazı
proteinlerin görevlerinin ve elde edilişlerinin anlaşılmasını
sağlamaktır. Böylece öğrencinin lisansüstü çalışmalarında
proteinler ile karşılaşabileceği sorunlarda daha başarılı
olması hedeflenmektedir.
Amino asitler, Modifiye Amino asitler, Proteinlerin yapısına
katılmayan Amino asitler, Peptid oluşumu-yapısı ve önemi,
Biyolojik öneme sahip peptidler, hormonlar, Amino asit
tepkimeleri, Genetik kod, protein sentezi ve Regülasyonu,
Protein Targeting, Protein katlamasında Şaperonlar,
Primer-Sekonder ve Tersiyer katlanmalar, Proteinlerin
sınıflandırılması, Bazı Önemli Proteinlerin yapı ve
fonksiyonları, Ribozom dışı yolla sentezlenen biyoaktif
peptidler, Proteinlerin Antijen Antikor özelliği, Protein
izolasyonu ve saflaştırılması, Proteinlerin fragmentasyonu,
Protein zincir dizisi analizi, Kristolografi ve üç boyutlu yapı
ulaşabilmesi için lisans seviyesinde bilgiye sahip olmaları
yeterlidir.
Principles of Biochemistry, Lehninger, Nelson and Cox
Biochemistry, Mathews van Holde
Ders teorik olarak anlatılarak aminoasit ve protein yapıları
bilgisayar ortamında şekil, resim, grafik ve animasyonlarla
amacıyla anlatımlar, soru cevap haline getirilerek tartışma
ortamı sağlanacaktır.
Ara sınav %30
Türkçe
BIO 5406 Bitki Moleküler Biyolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5406 Bitki Moleküler Biyolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, günümüzde bitki moleküler biyolojisinde
kullanılan yöntem ve tanımların öğretilmesidir. Dersin
hedefi öğrenciye yeni teknikleri öğretmek ve deneysel bakış
açısını genişletmektir.
Bitki hücrelerinin moleküler yapısı, bitkilerde somatik ve
gametik embryogenez, bitki gelişiminin moleküler analizi,
bitki hücre kültürlerinin özellikleri ve hazırlanması,
bitkilerde gen işleyişinin moleküler analizi, bitki
hücrelerine gen aktarım yöntemleri.
gerekmektedir.
Güncel makaleler
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
Yrd. Doç. Dr. Figen ERSOY
BİO5407 Moleküler Biyoloji Yöntemleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BİO5407 Moleküler Biyoloji Yöntemleri
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı yüksek lisans öğrencilerine moleküler biyoloji
araştırmalarında kullanılan farklı tekniklerin temel
prensiplerini ve uygulama alanlarını öğretmek ve tez
araştırmalarında kullanabilecekleri tekniklere teorik olarak
hazırlamaktır.
Hücre yapısında bulunan temel makromolekülleri
ayrıştırma, saflaştırma ve çeşitli analiz yöntemleri,
spektrofotometre kullanım ve uygulamaları, elektroforez,
kromatografi ve santrifuj tekniklerinin moleküler biyolojide
uygulamaları, radyoizotoplar otoradyografi ve kullanım
alanları, gen işleyişinin analizinde kullanılan moleküler
yöntemler ve kullanım alanları.
1. F.M. Ausubel, R. Brent, R.E. Kingston, D.D. Moore, J.G.
Seidman, J.A. Smith, K. Struhl. Current Protocols in
Molecular Biology. John Wiley & Sons.
2. R.F. Boyer. Modern Experimental Biochemistry. Second
Ed. The Benjamin/Cummings Publ. Co. Inc.
3. G. Temizkan, N. Arda. Moleküler Biyolojide Kullanılan
Yöntemler. 3. Baskı. Nobel Tıp Kitapevleri
Teorik sunum, güncel teknikleri içeren konularda
öğrencilerin makale/rapor sunumu
Türkçe
Prof.Dr. Sezai Türkel
--0 224 294 1782 / [email protected]
BIO 5408 Nükleik Asit Metabolizması
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO5408 Nükleik asit Metabolizması
3.0 / 7.5
Seçimli
Dersin amacı, DNA ile RNA’nın yapısı, sentez ve
yıkımlarının kavratılarak, Nükleik asitlerin hücredeki
önemlerinin tam olarak yerleştirilmesidir. Böylece
öğrencinin DNA ve RNA ile yapacağı deneylerde daha
Nükleik asitlerin Yapısı -Modifiye bazlar- NükleosidNükleotid yapısı, Nükleotid sindirimi, Pürin biyosentezi ve
sentezin
düzenlenmesi,
Pürin
katabolizması
ve
metabolizma bozuklukları, Pirimidin biyosentezi, sentezin
düzenlenmesi, Pirimidin katabolizması ve metabolizma
bozuklukları, Polinükleotidler (DNA-RNA), Nükleik asitlerin
analizi, Replikasyon, Mutasyonlar, Tamir mekanizmaları,
Kloroplast ve Mitokondri DNA’sı .
ulaşabilmesi için lisans düzeyindeki bilgiler yeterli
olacaktır.
Molecular Biology of the Cell, Alberts –Bray
Nucleic Acids, Victor A. Bloomfield
Ders teorik olarak anlatılarak DNA ve RNA yapıları
bilgisayar ortamında şekil grafik ve animasyonlarla
amacıyla, günlük hayatta karşılaşılan Gen Terapileri, GDO
gibi olaylar hakkında bilgiler verilerek tartışma ortamı
sağlanacaktır.
Ara sınav %30
Türkçe
BIO 5409 Mikrobiyal Fizyoloji
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bio5409 Mikrobiyal Fizyoloji
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin
amacında
öğrencinin
Mikroorganizmaların
fizyolojisi
hakkında
bilgilerinin
detaylandırılması
hedeflenmiştir.
Prokaryotik ve ökaryotik mikroorganismalara giriş;
Makromolekül sentezi:DNA,RNA,replikasyon ve protein
sentezi, gen ifadesinin düzenlenmesi; Membran yapısı ve
Transport; Katabolizma ve biosentez;Diğer mikrobiyal
metabolizmalar:Foto ve Kemoorganotrof ;Bakteriyel üreme
ve hücre bölünmesi; Çevresel Etkiler, Enerji ve
metabolizma: Önemli metabolik yollar;Mutasyon
Brock ,Biology of Microorganisms, M.T. Madigan,
J.M.Martinko, J.Parker
BBS2710 MİCROBIAL PHYSİOLOGY MODULE NOTES
Ders teorik olarak verilecektir. Ayrıca derslerde öğrencilere
konular verilerek araştırmaları istenecek ve seminer
halinde sunulacaktır.
Ara sınav %50
Türkçe
Doç. Dr. Elif DEMİRKAN
BIO 5410 Modern Biyokimyasal Laboratuar
Tekniklerine Giriş
Dersin Dönemi / Düzeyi Bahar / Yüksek Lisans
Dersin Kodu ve Adı Bio5410 Modern Biyokimyasal Laboratuar Tekniklerine
Giriş
Kredisi / ECTS Kredisi 3.0 / 7.5
Dersin Özelliği Seçmeli
Dersin Amacı ve Hedefi Dersin amacında öğrencinin Laboratuar çalışmalarında
kullanılan tekniklerin öğretilerek kendi çalışmalarında
kullanım kolaylığını sağlaması hedeflenmiştir.
Dersin İçeriği Bu teknikler protein kimyasını kapsamaktadır;
saflaştırma, karakterize etme, enzim deneyleri ve
kinetikleri, protein biyosentezi, spektrofotometre,
kromatografi, elektroforez, santrifügasyon, radyoizotop
işaretleme.
Kaynaklar Biocemical Techniques (Teory and Pratice),J.F.Robty,
B.J.White
Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler, G.Temizkan,
N.Arda
Öğretme Şekli Ders teorik ve pratik olarak verilecektir. Ayrıca derslerde
öğrencilere konular verilerek araştırmaları istenecek ve
seminer halinde sunulacaktır.
Değerlendirme Ara sınav %50
Dersin Öğretim Üyesi Doç. Dr. Elif DEMİRKAN
BIO 5411 Genel Mikrobiyolojide Uygulama
Teknikleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Bio5411 Genel Mikrobiyolojide Uygulama Teknikleri
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacında öğrencinin tez çalışmalarında faydalı
olacak olan laboratuar çalışmalarına hazırlaması
hedeflenmiştir.
Dersin İçeriği Aseptik teknik; mikroskop; sterilizayon ve yöntemleri;
besiyerleri; mikrobiyolojik örnek alma ve kültür
oluşturma; bakteri morfolojisi; boyama teknikleri;
endospor ve kamçının saptanması; önemli biyokimyasal
testler; sayım yöntemleri; küf ve mayalar.
Kaynaklar Gıda Mikrobiyolojisi ve Uygulamaları , A.K.Halkman
Genel Mikrobiyoloji Uygulama Teknikleri, A.Temiz
Öğretme Şekli Ders teorik ve pratik olarak verilecektir. Ayrıca derslerde
öğrencilere konular verilerek araştırmaları istenecek ve
seminer halinde sunulacaktır.
Değerlendirme Ara sınav %50
Dersin Öğretim Üyesi Doç. Dr. Elif DEMİRKAN
BIO 5412 Maya Genetiği ve Moleküler
Biyolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BİO5412 Maya Genetiği ve Moleküler Biyolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı maya genetiği alanında araştırma yapmak
isteyen yüksek lisans öğrencilerine bu alandaki teorik
bilgileri öğretmek, maya genetiği ve moleküler biyolojisi ile
ilgili konularda yapılan araştırmalarda kullanılan
tekniklerin temel prensiplerini öğretmektir.
Farklı maya türlerinin genetik yapısı ve genetik yapının
analizinde kullanılan yöntemler, maya hücrelerinin
moleküler yapısı, mayada metabolik olayların analizi ve
metabolizmanın genetik kontrolü, farklı maya türlerinin
biyoteknolojide kullanım alanları.
1. J.R. Broach, J.R. Pringle, E.W. Jones. The Molecular and
Cellular Biology of the Yeast Saccharomyces. Vol 1, 2, 3.,
CSHL press.
2. G.M. Walker. Yeast, Physiology and Biotechnology. John
Wiley & Sons.
3. D.C. Amberg, D.J. Burke, J.N. Strathern. Methods in Yeast
Genetics. CSHL Pres.
Teorik sunum, maya genetiği ve moleküler biyolojisi
alanında güncel konularda öğrencilerin makale sunumu.
Türkçe
Prof. Dr. Sezai Türkel
--0 224 294 1782 / [email protected]
BIO 5413 Gen Haritalama Yöntemleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bio5413 Gen Haritalama Yöntemleri
3.0 / 7.5
Seçmeli
BIO 5414 Moleküler Tanı Yöntemleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bio5414 Moleküler Tanı Yöntemleri
3.0 / 7.5
Seçmeli
BIO 5415 Sitoplazmik Genetik
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bio5415 Sitoplazmik Genetik
3.0 / 7.5
Seçmeli
BIO 5416 Proteomik
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5416 Proteomik
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, günümüzde protein seviyesinde kullanılan
tekniklerin öğretilmesidir. Dersin hedefi öğrenciye yeni
teknikleri öğretmek ve
deneysel
bakış
açısını
genişletmektir.
protein-protein etkileşimleri (maya ikili hibrid yöntemi ,
Co-immunoprecipitation), protein arrayleri, protein analiz
yöntemleri (ELİSA, MALDİ TOF, 2D jel, SDS PAGE vb.),
interaktome
gerekmektedir.
Güncel makaleler
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
BIO 5417 İşlevsel Genomik
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO5 417 İşlevsel Genomik
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, günümüzde moleküler biyolojide kullanılan
ileri tekniklerin ve kavramların öğretilmesidir. Böylece
öğrencinin lisansüstü çalışmalarda karşılaşabileceği
problemlerinde yeni bir bakış açısı geliştirerek başarılı
miRNA, siRNA (gen susturma), microarray, Farklılık
Gösterimi (Diffrential Display), EST (Expressed Sequence
Tag), Subtraktif melezleme, SAGE, cDNA kütüphanesi
hazırlanması, post translasyonal modifikasyonlar, RNA
izolasyonu.
gerekmektedir.
Güncel makaleler
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
BIO5419 Gen Transfer Metotları ve Vektörler
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5419 Gen Transfer Methodları ve Vektörler
3.0 / 7.5
Seçmeli
Dersin amacı, günümüzde moleküler biyolojide kullanılan
gen transfer tekniklerinin ve kullanılan vektörlerin
öğretilmesidir. Böylece öğrencinin lisansüstü çalışmalarda
karşılaşabileceği problemlerinde yeni bir bakış açısı
geliştirerek başarılı olması hedeflenmektedir.
Plasmidlerin moleküler yapıları, vektör çeşitleri, vektör
dizaynı, prokaryotik ve ökaryotik genlerin ekspresyonu
gerekmektedir.
1. Güncel makaleler
2. Principles of Gene Manuplation
R.W.OLD
S.B. PRIMROSE
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Ara sınav %50
Türkçe
BIO 5500 Sindirim sistemi fizyolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Bahar /Yüksek Lisans
BIO 5500 Sindirim sistemi fizyolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
Hayvanlar ve diğer heteretroflarda besin alınması ve
işlenmesi,
omurgalılarda
gastrointestinal
sistem
fonksiyonlarının açıklanması
Hayvanlar ve diğer heteretroflarda besin alınması ve
işlenmesi, heteretrof organizmaların besin gereksinmesi,
hayvanlar ve protozoonların besin alması, insanın ve diğer
omurgalıların sindirim sistemi-gastrointestinal (GIS)kanal
duvarının yapısı, sindirim ve absorbsiyon -karbonhidrat,
lipit, yağ, vitaminler, su ve mineraller- GIS işlemlerinin
regülasyonu- nöral, hormonal, regülasyon, GIS’in kontrol
evreleri, ağız, farinks özofagus, mide HCL sekresyonu,
pankreas sekresyonları, safra sekresyonları, ince bağırsak
sekresyonu, motilitesi, kalın bağırsak sekresyonu ve
motilite-, GIS’in fizyopatolojisi
MedicalPhysiology,:Arthur C Guyton and John E Hall
Human anatomy and Physiology: Robert CArola, John P
Harley, Charles R Noback
Biological Science; I,II: William T. Keeton, James L Gould
Türkçe
Doç. Dr. Sibel TAŞ
BIO 5501 Taksonomik Zoolojinin prensipleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5501 Taksonomik Zoolojinin Prensipleri
3.0 / 7.5
Zorunlu
Sistematiğin tanımı ve tarihçesi; sistematik ve taksonomi;
taksonomik
karakterler;
taksonomik
kategoriler;
varyasyonlar; taksonomik araştırmalar; taksonomik
yayınlar; hayvan isimlendirmesinin uluslararası kuralları;
homonym, synonim ve tip kavramları gibi temel
taksonomik
terimlerin
öğrencilere
öğretilmesi
hedeflenmektedir.
Taksonomi ve sistematik terimlerinin açıklanması,
taksonominin
görevleri,
Sınıflandırmanın
safhaları,
sınıflandırmanın tarihi, taksonomistin görevleri ve
karşılaştığı güçlükler ve uygulamalı biyoloji, taksonomik
araştırmaların planlanması, lokal faunanın incelenmesi,
taksonominin biyolojinin diğer kolları ile ilişkisi, Taksonomi
ve istatistik; sistematik kategoriler, populasyon, varyasyon,
sistematikçinin yaptığı görevler, tür ve türaltı kategoriler,
hayvan isimlendirmesinin uluslararası kuralları, homonim
ve sinonim kavramları, tip kavramı, taksonomik yayınlar.,
taksonomide kullanılan karakterlerin (Morfolojik ve
anatomik karakterler) ayrıntılarıyla anlatılması.
1- Lodos, N. Ve Önder F. (1985): Uluslararası Zooloji
İsimlendirme Yasası (1974’ de yayınlanan en son
değişiklikler ve Mayr 1969’in açıklamalarıyla
birlikte)(orijinal metinden aynen tercüme). Ege Üniversitesi
Ziraat Fakültesi Yayınları No:472, Bornova. 204s.
2- Mayr, E.(1969): Principles of Systematic Zoology.
McGraw-Hill Book Co., New York.428 s.
3- Önder F. 1998. Taksonomi İlkeleri. Ege Üniversitesi
Ziraat Fakültesi Ofset Atölyesi. Bornova/İzmir.
4- Yılmaz, İ. 1997. Taksonomik Zoolojinin Prensipleri. Oran
Yayıncılık 1. baskı. İzmir.
Teorik sunum, Soru-cevap
Yarıyıl sonu sınavı %100
Türkçe
Prof. Dr. İsmail Hakkı UĞURTAŞ
Prof. Dr. Hikmet Sami YILDIRIMHAN
0 224 29 41791 [email protected]
0 224 29 41790 [email protected]
BIO 5502 Zoolojide Ekskürsiyon Çalışmaları
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5502 Zoolojide Ekskürsiyon Çalışmaları
3.0 / 7.5
Seçmeli
olduğu hayvan sistematiği derslerinin tam olarak
yerleştirilmesi arazi çalışmaları yapmaktır. Böylece
öğrencinin lisansüstü çalışmalarda kullanacağı hayvanları
arazide
toplanma
işlemlerinin
nasıl
yapılacağı
hedeflenmektedir.
Arazide gözlemler, arazi çalışması nasıl yapılır, arazide
ekolojik verilerin önemi, hayvan örneklerini toplama
yöntemleri, taşıma ve koleksiyon yapma, hayvan
örneklerini toplamada dikkat edilecek hususlar, Arazi
çalışmalarında fotografi.
bu dersin içeriğinde belirtilen konular hakkında daha önce
lisans seviyesinde bilgiye sahip olmaları gerekmektedir.
Türkiye Amfibileri, Necla Özeti, İrfan Yılmaz, Ege Üniv. Fen
Fak. 1994.
Türkiye Sürüngenleri kısım I, Muhtar Başoğlu, İbrahim
baran, Ege Üniv. Fen Fak. 1977.
Türkiye Sürüngenleri kısım II, Muhtar Başoğlu, İbrahim
Baran, Ege Üniv. Fen Fak. 1980.
Dersin bir kısmı teorik olarak sunum şeklinde verilecektir.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir. Ayrıca dersin konusu ile alakalı arazi
çalışmaları yapılacaktır.
Türkçe
BIO5503 Protozooloji
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5503 Protozooloji
3.0 / 7.5
Seçmeli
Rhizopoda, Flagellata, Ciliata, Cnidosporidia ve Sporozoa
filumunun genel özellikleri, ekolojileri ve parazitik etkileri,
yaşam döngüleri, morfolojileri ile bu grup hayvanların
özelliklerinin bilinmesi hedeflenmektedir.
Protozoonların genel karakterleri, Flagellata, Rhizopoda,
Ciliata, Sporozoa filumlarının genel karakterleri,
sınıflandırılmaları ve alt grupların özellikleri ders içeriğini
oluşturmaktadır.
1- Kreier J.P. and Baker J. R. 1987. Parasitic
Protozoa.Chapman & Hall. England.
2- Cox F. E. G. 1993. Modern Parasitology.Blackwell
Scientific Publications. Second Edition. Paris.
3- Harris C. L. 1992. Concepts in Zoology. Harper Collins
Publishers. New York.
4- Margulis L., McKhann I. H., Olendzenski L. 1993.
Illustrated Glossary of Protoctista. Jones and Bartlett
Publishers. London.
Türkçe
Prof.Dr. F. Naci ALTUNEL
--0 224 29 41784 / [email protected]
BIO 5504 Parazit Teşhis Yöntemleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
BIO 5504 Parazit Teşhis Yöntemleri
3.0 / 7.5
Seçmeli
Çalışmalarını parazitolojik alanda yapacak olan yüksek
lisans öğrencilerine her grup parazitleri nasıl ve hangi
yöntemlerle
teşhis
edebileceklerini
öğretmek
hedeflenmiştir.
Dersin İçeriği Tek hücreli organizmalardan çok hücreli organizmalara
kadar her tür parazit hayvanı değişik yöntemlere göre nasıl
teşhis edileceği anlatılmaktadır. Genel olarak bu yöntemler
parazitin kendisinin, larva veya yumurta gibi gelişme
şekillerinden birinin saptanması esasına dayanmaktadır.
Dışkı, kan, deri, idrar, organ v.s. örneklerinin rutin muayene
yöntemlerinin yanı sıra paraziter enfeksiyonların tanısı
amacıyla kullanılan moleküler ve serolojik tanı yöntemleri
tanıtılarak
parazitolojide
kullanımı
ve
yararları
aktarılacaktır. Parazitlerin bazı gelişme aşamalarının in
vivo ve in vitro ortamlarda üretilmesi ve geliştirilmesi
hakkında bilgi verilecektir.
Dersin Önşartı / Öneriler Dersin ön şartı yoktur.
Kaynaklar 1-Tınar R., Umur Ş., Köroğlu E., Güçlü F., Ayaz E., Şenlik B.,
Muz N. M. 2006. Helmintoloji. Birinci Baskı, Nobel Yayın
Dağıtım, Ankara.
2-Altıntaş, K. , 1997 Tıbbi Parazitoloji Atlası
3-Çetin, E. T. Ve ark. , 1983. Tıbbi Parazitoloji
4-Unat E.K. ,Yücel A. , Atlas K. , Samastı M. , 1991, Unat'ın
Tıp Parazıtolojısı , Dördüncü Baskı İstanbul ünıversıtesı
Cerrahpasa Tıp Fakültesı Yayınları İstanbul.
5- Göçmen, B. 2000. Genel Parazitoloji. Ege Üniversitesi,
İzmir.
6-Beck, J.M. and Davies J.E. 1976 . Medical Parasitology
2nd Ed. The C.V.Mosby Co. , Saint Louis.
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
Teorik sunum, Soru-cevap, Pratik Uygulama.
Türkçe
Prof.Dr. Hikmet Sami YILDIRIMHAN
--0 224 29 41790/ [email protected]
BIO 5505 Reptil Biyolojisi
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5505 Reptil Biyolojisi
3.0 / 7.5
Seçmeli
olduğu sistematik konulu derslerinin tam olarak
yerleştirilmesi ve var ise eksik konuların tamamlanmasıdır.
Böylece
öğrencinin
lisansüstü
çalışmalarda
karşılaşabileceği reptiller ile alakalı konularda başarılı
Sistematik, Üreme stratejileri, aşk oyunları ve çiftleşme,
yumurta-yavru gelişmesi, çevre ile ilişkileri, besin ve
beslenme, düşmanlar ve korunma.
Snakes, Harry W. Grene, University of California Pres, 1997
Türkiye Herpetofaunası, İbrahim Baran, M.K. Atatür, Çevre
Bakanlığı, 1998.
Türkiye Sürüngenleri kısım I, Muhtar Başoğlu, İbrahim
Türkiye Sürüngenleri kısım II, Muhtar Başoğlu, İbrahim
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Türkçe
BIO 5506 Hayvanlarda Sosyal Davranışlar
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5506 Hayvanlarda Sosyal davranışlar
3.0 / 7.5
Seçmeli
olduğu hayvanları konu eden derslerinin tam olarak
yerleştirilmesi ve eksik konuların tamamlanmasıdır.
Böylece
öğrencinin
lisansüstü
çalışmalarda
karşılaşabileceği hayvan davranışı konularında başarılı
Davranış biyolojisinin gelişimi, sosyal davranış çeşitleri,
çiftleşme davranışları ve biyolojik önemi, aile yaşamı ve
biyolojik önemi, kavga ve kavganın önemi.
Hayvanlarda Sosyal Davranışlar, Rüştü Şahin, Hatiboğlu
yayınevi, 1986
Etoloji, Rüştü Şahin ve Murat Biricik, Dicle Üniv. Basımevi,
1997.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Türkçe
BIO 5507 Hormonlar ve Omurgalılarda Üreme
Zooloji Anabilim Dalı
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5507 Hormonlar ve omurgalılarda üreme
3.0 / 7.5
Seçmeli
Vertebrata
ve
invertebratalarda
endokrin
sistem
fonksiyonlarının karşılaştırmalı olarak incelenmesi
Vertebrata ve invertebratalarda endokrin sistem, hormon
yapıları ve sentezi, kanda hormon taşınması, hormon
metabolizması ve atılımı, hormon sekresyonunu kontrol
eden uyarı tipleri, -hipotalamus ve hipofizi içeren kontrol
sistemleri- arka ve ön hipofiz hormonları ve fonksiyonları,
aday
hormonlar,
omurgalılarda
üreme,
endokrin
sekresyonundaki bozulmalar sonucu ortaya çıkan
durumların açıklanması.
MedicalPhysiology,:William F Ganong
Türkçe
BIO 5508 Helmintoloji
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5508 Helmintoloji
3.0 / 7.5
Seçmeli
Plathelminthes (Turbellaria, Temnocephala, Monogena,
Digenea,
Cestoderia,
Cestoda),
Nemathelminthes,
Nematomorpha ve Acanthocephala filumlarının genel
karakterleri, sınıfları, sınıflarının genel karakterleri, gelişim
ve sınıflandırılması ile ilgili bilgilerin öğrencilere
aktarılması hedeflenmektedir.
Plathelminthes (Turbellaria, Monogena, Digenea, Cestoda),
Nemathelminthes, Nematomorpha ve Acanthocephala
filumlarının genel karakterleri, sınıfları, sınıflarının genel
karakterleri, gelişim, üreme ve sınıflandırılması ile ilgili
bilgiler dersin içeriğini oluşturmaktadır.
1-Dollfus R. 1946. Parasites des Helminthes. Encyclopedie
Biologique. Paris.
2- Harris C. L. 1992. Concepts in Zoology. Harper Collins
Publishers. New York.
3-Tınar R., Umur Ş., Köroğlu E., Güçlü F., Ayaz E., Şenlik B.,
Muz N. M. 2006. Helmintoloji. Birinci Baskı, Nobel Yayın
Dağıtım, Ankara.
Türkçe
Prof. Dr. F. Naci ALTUNEL
--0 224 29 41784 / [email protected]
BIO 5509 Kasların ve İskeletin Yapısal Düzeni
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5509 Kasların ve iskeletin yapısal düzeni
3.0 / 7.5
Seçmeli
Kas tipleri ve kasılma mekanizmalarının canlılarda
karşılaştırmalı olarak incelenmesi.
Hidrostatik iskeletli hayvanlar,sert ve eklemli iskeletli
hayvanlar, omurgalılarda iskelet kası kontraksiyonunun
moleküler mekanizması,-kayan filament mekanizması,
troponin, tropomiyozin, kalsiyumun rolü, -tek lif
kontraksiyon mekanizması- kontraksiyon sarsısı, frekansgerim, yük-gerim ilişkisi, iskelet kası enerji metabolizması,
kas yorgunluğu, tam kas kontraksiyonu, iskelet kası
hastalıkları, kalp kası ve kasılmasının moleküler
mekanizması, kalp kasının kasılması üzerine etkili
hormonlar, düz kas tipleri, düz kasta kontraksiyonunun
moleküler mekanizması ve kontrolü, hormonların etkisi.
MedicalPhysiology, :Arthur C Guyton and John E Hall
Türkçe
--0224 29 41795 / e-posta: [email protected]
BIO 5510 Zehirli Hayvanlar ve Toksinleri
Dersin Kodu ve Adı
Dersin Özelliği
Dersin İçeriği
Kaynaklar
Öğretme Şekli
Değerlendirme
Eğitim Dili
Dersin web sayfası
İletişim
BIO 5510 Zehirli Hayvanlar ve Toksinleri
3.0 / 7.5
Seçmeli
olduğu zehirli hayvanlarla alakalı konuların yerleştirilmesi
ve daha ileri seviyede bu konuların öğrenilmesidir. Böylece
öğrencinin lisansüstü çalışmalarda ihtiyaç duyabileceği bu
konu ile ilgili bilgilerin öğrenilmesi hedeflenmektedir.
Zehirli yılanların sistematikteki yeri, bugünkü duruma göre
dünyada bulunan zehirli yılan familyaları ve genel
özellikleri, bu familyalara ait türlerin üreme ve beslenme
biyolojileri, zehirli yılanlardan zehir elde edilmesi ve bu
zehrin ekonomideki ve tıptaki yeri.
Venoms and Poisonous Animals, Anders Edstrom, Krieger
Publisshing Company, Florida, 1992.
seminer
şeklinde
tartışma
ortamı
yaratılarak
sürdürülecektir.
Türkçe

BIO 5100 Bitki Ekofizyolojisi Biyoloji Anabilim Dalı

Transkript

Benzer belgeler

ELN6304 Biyoelektromanyetizma Elektronik Mühendisliği Anabilim

Ders Dosyası - Uçak Gövde

Türk-Alman Üniversitesi Hukuk Fakültesi Ders Bilgi Formu

Pazarlama Yönetimi

Sömürge sonrası Edebiyatı (ELIT 412) Ders Detayları

en221-istatistik yöntemler

Personel Emniyeti ve Sosyal Sorumluluk

PSIR - Siyaset Bilimi ve Uluslararası İlişkiler