digene ® HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı
Transkript
digene ® HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı
digene® HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 96 İnsan papillomavirüs (HPV) tipleri 16, 18 ve 45'in kalitatif olarak saptanması için. digene HC2 High-Risk HPV DNA Testiyle kullanılmak üzere. 613615 QIAGEN 19300 Germantown Road Germantown, MD 20874 A.B.D. www.qiagen.com QIAGEN GmbH QIAGEN Strasse 1 40724 Hilden ALMANYA 1058098TR Rev. 02 Sample & Assay Technologies İçindekiler Kullanım Amacı 6 Özet ve Açıklama 6 İşlemin Prensibi 7 Denatürasyon 7 Hibridizasyon 7 Hibrid yakalama 7 Hibrid saptama 7 Yıkama 7 Sinyal amplifikasyonu 7 Sağlanan Materyal 10 Kit içeriği 10 Gereken Ama Sağlanmayan Materyal 11 QIAGEN'den sağlanabilen ekipman ve materyal 11 PreservCyt örnek hazırlama için ek ekipman ve materyal 12 Uyarılar ve Önlemler 13 Uyarılar 13 Önlemler 15 Reaktif Saklama ve Muamele 17 Kit bileşenleri 17 Hazırlanan reaktifler 17 Numune Toplama ve Hazırlama 17 STM'de servikal örnekler 18 PreservCyt Solüsyonu içinde servikal numuneler 18 İşlem 19 Reaktif hazırlama 21 Örnek hazırlama 26 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 3 Protokol 1: Denatürasyon 27 Protokol 2: Prob karışımı ekleme 29 Protokol 3: Hibridizasyon ve hibrid yakalama 32 Protokol 4: Hibrid saptama 34 Protokol 5: Yıkama 36 Protokol 6: Sinyal amplifikasyonu 39 Protokol 7: Yakalama mikroplakalarını ölçme ve sonuç oluşturma 40 Sonuçların Yorumlanması 41 Test sonuçları 41 Sorun Giderme kılavuzu 41 Kalite Kontrol Test kalibrasyonu doğrulama 50 Prob spesifik kalite kontroller 52 Sınırlamalar 53 Performans Özellikleri 53 digene HPV Genotyping PS Testi ve doğrulanmış bir kantitatif PCR HPV genotipleme testi arasında anlaşma 53 Analitik özgüllük 55 Tekrar Üretilebilirlik 56 STM ve PreservCyt numuneleri için DNA geri alınması 57 Çapraz reaktivite 57 Kan ve diğer maddelerin STM numunelerine etkisi 58 Kan ve diğer maddelerin PreservCyt numunelerine etkisi 59 Referanslar Atıfta bulunulan referanslar 4 50 59 59 Semboller 61 İrtibat Bilgisi 61 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Ek A: Kontaminasyon Değerlendirme İşlemleri 62 Saptama Reaktifi 2 62 Yıkama Aygıtı ve/veya su kaynağı 62 Automated Plate Washer 63 Ek B: Test Verileri Kaydetme Çalışma Sayfası 64 Sipariş Bilgisi 65 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 5 Kullanım Amacı digene HPV Genotyping PS Testi pozitif bir digene HC2 High-Risk HPV DNA Testi (13 yüksek riskli tipin kalitatif olarak saptanması) sonucu sonrasında yüksek riskli HPV tipleri 16, 18 ve 45'in kalitatif olarak saptanması için kullanılması amaçlanmış bir refleks testtir. Yüksek riskli HPV tipleri 16, 18 ve 45'in tanımlanması servikal kanser tarama programlarında hastaların klinik takibine yardımcı olmak üzere ek bilgi sağlar. digene HPV Genotyping PS Testiyle test edilebilecek servikal örnekler arasında şunlar vardır: digene HC2 DNA Collection Device ile toplanan örnekler Süpürge tipi bir toplama cihazı veya fırça/spatül kombinasyon toplama cihazıyla toplanıp sonra PreservCyt® Solüsyonuna yerleştirilen örnekler Özet ve Açıklama Dişi genital kanalında bazı HPV tiplerinin bulunması kondiloma, Bowenoid papulosis ve servikal, vajinal ve vulvar intraepitelyal neoplazi ve karsinom dahil olmak üzere çeşitli hastalıklarla ilişkilidir (1–3). Genel olarak bu virüslerin temelde cinsel yolla geçtiği kabul edilir ve yüksek riskli HPV tipleri servikal kanser gelişmesi için temel tanınan risk faktörüdür (4–8). İnsan papillomavirüsleri bir protein kapsidiyle sarılı 8000 baz çiftlik, çift iplikli dairesel bir DNA molekülü içeren ikozahedral bir viral partikülden (virion) oluşur. Epitelyal hücrelerin enfeksiyonundan sonra viral DNA epitelin tüm kalınlığı boyunca yerleşir ama sağlam virionlar sadece dokunun üst tabakalarında bulunur. Viral DNA lezyonun tipi ve derecesine bağlı olarak virionlar veya epizomal ya da entegre HPV sekansları olarak bulunabilir. Fizik inceleme yoluyla ve Pap yayma veya biyopsi örneklerinde viral replikasyonla ilişkili karakteristik hücresel değişikliklerin varlığıyla anogenital HPV enfeksiyonunun dolaylı bulguları görülebilir. Alternatif olarak biyopsiler HPV DNA varlığını doğrudan saptamak üzere nükleik asit hibridizasyonu ile analiz edilebilir. Normal sitolojisi olan ve HPV 16 veya 18 için aynı zamanda pozitif test veren kadınlarda 12 yıllık takip süresinde servikal intraepitelyal neoplazi (CIN) 3 veya daha kötüsünün gelişme olasılığı sırasıyla %26,7 ve %19,1 olarak tahmin edilmektedir (9). Ayrıca, HPV tipleri 16, 18 ve 45 skuamöz hücreli karsinom, adenokarsinom ve adenoskuamöz hücreli karsinomda en sık bulunan 3 genotip olmuştur. Bu 3 HPV tipi birlikte skuamöz hücre karsinomu 6 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı vakalarının %75'i ve adenokarsinom vakalarının %94'ünde bulunmuştur (10). Ayrıca HPV 18 veya 45 içeren tümörlerin diğer HPV tiplerini içeren tümörlere göre 2 kat fazla ölüme neden olma olasılığı olduğu gösterilmiştir (11). İşlemin Prensibi digene HPV Genotyping PS Testi, Hybrid Capture® 2 (HC2) teknolojisi kullanarak tipe spesifik oligoribonükleotidler, antikor yakalama ve kalitatif kemilüminesans sinyal saptama kullanan bir in vitro nükleik asit hibridizasyon testidir. Her servikal örnekte üçlü olarak yapılan test servikal örneklerde 3 yüksek riskli HPV DNA tipi (16, 18 ve 45) için genotipleme yapar. Denatürasyon Servikal örnekler virüsü parçalayıp hedef DNA'yı serbest bırakan bir baz solüsyonla muamele edilir. Hibridizasyon Hedef HPV DNA spesifik RNA problarıyla hibridizasyona girip DNA–RNA hibridleri oluşturur. Hibrid yakalama DNA–RNA hibridlerine spesifik ve bir mikroplaka kuyusunun yüzeyine kaplanmış antikorlar DNA–RNA hibridlerini yakalar. Hibrid saptama Saptama Reaktifi 1 (DR1) eklenmesiyle immobilize edilmiş DNA–RNA hibridleri, DNA–RNA hibridlerine spesifik alkalen fosfataz konjuge antikorlarla reaksiyona girer. Her antikora birkaç alkalen fosfataz molekülü konjuge edilmiştir ve her immobilize edilmiş DNA-RNA hibridine çok sayıda antikor bağlanır ve böylece önemli bir sinyal amplifikasyonu olur. Yıkama DNA–RNA hibrid kompleksi bağlanmamış materyali gidermek üzere yıkanır. Sinyal amplifikasyonu Saptama Reaktifi 2 (DR2) eklenmesiyle substrat bağlanmış alkalen fosfatazla yarılırken kemilüminesan reaksiyon oluşur. Saçılan ışık bir DML aletinde bağıl digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 7 ışık üniteleri (RLU) olarak ölçülür. Saçılan ışığın şiddeti örnekte hedef DNA varlığını gösterir. 8 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Hibrid Yakalama İş Akışı Denatürasyon Hibridizasyon RNA probu Tek iplikli DNA DNA-RNA hibridi Hibrid Yakalama Hibrid saptama Yıkama Sinyal amplifikasyonu digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 9 Sağlanan Materyal Kit içeriği digene HPV Genotyping PS Test (96) Katalog no. 613615 Test sayısı* 96 HPV Negative Control 1 (HPV Negatif Kontrol 1) 1 ml HPV Positive Control 1 (HPV Pozitif Kontrol 1) 1 ml HPV Negative Control 2 (HPV Negatif Kontrol 2) 1 ml HPV Positive Control (HPV Pozitif Kontrol 2) 1 ml Denaturation Reagent (Denatürasyon Reaktifi) 12 ml Indicator Dye (Gösterge Boya) 0,35 ml Probe Diluent (Prob Seyreltici) 5,5 ml Detection Reagent 1 (Saptama Reaktifi 1) 12 ml Detection Reagent 2 (Saptama Reaktifi 2) 12 ml Wash Buffer x15 (Yıkama Tamponu x15) 2 x 100 ml HPV 16 Probe ASR (HPV 16 Probu ASR) 110 µl HPV 18 Probe ASR (HPV 18 Probu ASR) 100 µl * Test sonucu sayısı, her test yapılması için kontroller gerektiğinden kit başına kullanım sayısına göre değişir. Denatüre edilmiş kontroller için izin verilen dondurma/çözme döngüsü sayısı da kit başına kullanım sayısında bir faktör olabilir. Ek bilgi için bakınız “İsteğe bağlı durma noktası”, sayfa 28. 10 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı HPV 45 Probe ASR (HPV 45 Probu ASR) 5.5% NP-40 (%5,5 NP-40) Capture Microplate (Yakalama Mikroplakası) 100 µl 2 x 1,5 ml 1 Gereken Ama Sağlanmayan Materyal Kimyasallarla çalışırken daima uygun bir laboratuvar önlüğü, tek kullanımlık eldivenler ve koruyucu gözlükler kullanın. Daha fazla bilgi için, ürün tedarikçisinden elde edilebilecek uygun güvenlik veri sayfalarına (SDS'ler) başvurun. QIAGEN'den sağlanabilen ekipman ve materyal digene Hybrid Capture 2 Sistemi (“digene HC2 Sistemi”), bir QIAGEN onaylı luminometre (“DML aleti”), QIAGEN onaylı kişisel bilgisayar ve bilgisayar periferal donanımı (monitör, klavye, fare, yazıcı ve yazıcı kablosu), digene HC2 System Software (“digene test analiz yazılımı”), LumiCheck Plaka Yazılımı ve digene HC2 Sistem Yazılımı Kullanıcı El Kitabından (digene HC2 System Software User Manual) oluşur Hybrid Capture System Rotary Shaker I Hybrid Capture System Automated Plate Washer Hybrid Capture System Multi-Specimen Tube (MST) Vortexer 2 (isteğe bağlı) Hibridizasyon mikroplakaları Mikroplaka kapakları Ekstra uzun pipet uçları Tek kullanımlık reaktif rezervuarları DuraSealTM tüp mühürleyici film Plaka mühürleyiciler digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 11 Genel Laboratuvar Kullanımı Ekipmanı ve Aksesuarlar 55 ± 2ºC sıcaklığı devam ettirebilen ve 1100 ± 100 devir/dk hızında sallayabilen inkübatör sallayıcı Mikrosantrifüj Kap ataşmanlı vorteksleyici Tek kanallı pipet, 20–200 µl ve 200–1000 µl hacimler için değişken ayarlar Eppendorf® Repeater® pipet gibi tekrarlayan pozitif displasman pipeti 8 kanallı pipet (çoklu kanallı); 25–200 µl hacimler için değişken ayarlar Süre Ölçer Sodyum hipoklorür çözeltisi, %0,5 h/h Parafilm® veya eşdeğeri Tek kanallı pipet (20–200 µl ve 200–1000 µl) için tek kullanımlık aerosol bariyerli pipet uçları Tekrarlayan pozitif displasman pipeti (12,5, 5, 2,5 ve 1,25 ml) için tek kullanımlık uçlar 8 kanallı pipet (25–200 µl) için tek kullanımlık uçlar KimTowels® kağıt havluları veya eşdeğeri az tiftikli kağıt havlular Alkollü mendiller Tek kullanımlık tezgah örtüsü Pudrasız tek kullanımlık eldivenler 1,5 ml ve/veya 5 ml yuvarlak altlı polipropilen tüpler Yüzen mikrosantrifüj tüp askısı PreservCyt örnek hazırlama için ek ekipman ve materyal digene HC2 Sample Conversion Kiti kullanma talimatına bakınız. 12 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Uyarılar ve Önlemler İn vitro diagnostik kullanım için. Uyarılar Kimyasallarla çalışırken daima uygun bir laboratuvar önlüğü, tek kullanımlık eldivenler ve koruyucu gözlükler kullanın. Daha fazla bilgi için, lütfen uygun güvenlik veri sayfalarına (SDS'ler) başvurun. Bunlar çevrim içi olarak PDF halinde www.qiagen.com/safety adresinde yer almaktadır ve kullanıcılar burada her QIAGEN kiti ve kit bileşeni için SDS'yi bulabilir, okuyabilir ve yazdırabilir. Numuneler DİKKAT: Numuneler enfeksiyöz ajanlar içerebilir ve uygun şekilde muamele edilmelidir. Tüm numuneleri enfeksiyöz olabilir olarak kabul edin. Bilinen hiçbir test yöntemi numunelerin enfeksiyon bulaştırmayacağı konusunda tam güvence veremez. İnsan numunelerine, uygun ulusal ve yerel biyogüvenlik uygulamalarına göre muamele edilmesi önerilir. Enfeksiyöz ajanlar içeren veya içermesinden şüphelenilen materyal ile bu biyogüvenlik uygulamalarını kullanın. Bu önlemler arasında verilenlerle sınırlı olmamak üzere şunlar vardır: Ağızla pipetlemeyin. Reaktifler veya numunelerin kullanıldığı yerlerde sigara içmeyin ve bir şey yiyip içmeyin. Reaktifler veya numuneleri kullanırken tek kullanımlık, pudrasız eldivenler giyin. Testi yaptıktan sonra ellerinizi iyice yıkayın. Tüm numune döküntülerini %0,5 h/h sodyum hipoklorür gibi tüberkülosit bir dezenfektan veya başka uygun bir dezenfektanla temizleyin ve dezenfekte edin (12, 13). Numuneler, reaktifler ve diğer kontamine olmuş olabilecek materyali yerel ve ulusal düzenlemelerle uyumlu olarak dekontamine edin ve atın. Denatürasyon ve inkübasyon sonrasında numuneler artık enfeksiyöz kabul edilmez (14); ancak laboratuvar personeli halen ulusal ve yerel önlemlere uymalıdır. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 13 Sodyum azit Bazı reaktifler sodyum azit içerir. Sodyum azitin laboratuvar su borularında kurşun veya bakır azid oluşturduğu bildirilmiştir. Bu azitler çekiçle vurma gibi perküsyon durumunda patlayabilir. Kurşun veya bakır azit oluşumunu önlemek için sodyum azit içeren solüsyonları attıktan sonra lavabolardan iyice su akıtın. Azit biriktiğinden şüphelenilen eski lavabolardan kontaminasyonu gidermek için A.B.D. Mesleki Güvenlik Sağlık İdaresi şunları önerir: 1. Alt kısımdan sıvıyı bir lastik veya plastik hortum kullanarak boşaltın. 2. %10 h/h sodyum hidroksit solüsyonuyla doldurun. 3. 16 saat bekleyin. 4. İyice su akıtın. Bileşenler için güvenlik ve risk ifadeleri digene HPV Genotyping PS Test kiti bileşenleri için aşağıdaki risk ve güvenlik ifadeleri geçerlidir: 5.5% NP-40 Içerir: Ethoxylated nonylphenol. Uyarı! Hafif derecede deri tahrişine neden olur. Uzun süreli etkilerle sudaki yaşam için zararlıdır. Çevreye yayılmasını önleyiniz. İçerik/ kabı onaylanmış atık atım tesisine atınız. Denaturation Reagent Içerir: sodium hydroxide. Tehlike! Ciddi derecede deri yanıkları ve göz hasarına neden olur. Metaller için aşındırıcı olabilir. İçerik/ kabı onaylanmış atık atım tesisine atınız. GÖZE KAÇMIŞSA: Birkaç dakika iyice suyla durulayınız. Eğer mevcut ve kolaysa kontak lensleri çıkarınız. Durulamaya devam ediniz. DERİYE BULAMIŞSA (ya da saça): Hemen tüm bulaşmış giyisileri çıkarınız. Deriyi suyla yıkayınız. Hemen ZEHİR MERKEZİ veya doktora başvurunuz. Kilit altında saklayınız. Koruma eldiveni/ koruyucu giysi/ göz koruması/ yüz koruması kullanınız. Detection Reagent 1 Uzun süreli etkilerle sudaki yaşam için zararlıdır. Çevreye yayılmasını önleyiniz. HPV Negative Control 1 Uyarı! Hafif derecede deri tahrişine neden olur. Deride tahriş olursa: Tıbbi yardım alınız. HPV Positive Control 1 Uyarı! Hafif derecede deri tahrişine neden olur. Deride tahriş olursa: Tıbbi 14 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı yardım alınız. HPV Positive Control 2 Uyarı! Hafif derecede deri tahrişine neden olur. Deride tahriş olursa: Tıbbi yardım alınız. HPV PS Negative Control Uyarı! Hafif derecede deri tahrişine neden olur. Deride tahriş olursa: Tıbbi yardım alınız. Probe Diluent Içerir: acetic acid; Polyacrylic acid. Tehlike! Ciddi derecede deri yanıkları ve göz hasarına neden olur. İçerik/ kabı onaylanmış atık atım tesisine atınız. GÖZE KAÇMIŞSA: Birkaç dakika iyice suyla durulayınız. Eğer mevcut ve kolaysa kontak lensleri çıkarınız. Durulamaya devam ediniz. DERİYE BULAMIŞSA (ya da saça): Hemen tüm bulaşmış giyisileri çıkarınız. Deriyi suyla yıkayınız. Hemen ZEHİR MERKEZİ veya doktora başvurunuz. Kilit altında saklayınız. Koruma eldiveni/ koruyucu giysi/ göz koruması/ yüz koruması kullanınız. Wash Buffer, 15x Içerir: Sodium azide. Uyarı! Yutulması halinde zararlıdır. Hafif derecede deri tahrişine neden olur. Uzun süreli etkilerle sudaki yaşam için zararlıdır. Çevreye yayılmasını önleyiniz. İçerik/ kabı onaylanmış atık atım tesisine atınız. Deride tahriş olursa: Tıbbi yardım alınız. YUTULMASI HALİNDE: Hemen ZEHİR MERKEZİ veya doktora başvurunuz. Koruma eldiveni/ koruyucu giysi/ göz koruması/ yüz koruması kullanınız. Ek bilgi Güvenlik Veri Sayfaları: www.qiagen.com/safety Önlemler Kullanıcı digene HPV Genotyping PS Testini yaparken şu önlemlere daima uymalıdır: Reaktifleri dış kutu etiketinde sembolü yanında belirtilen son kullanma tarihi veya hazırlanmış reaktiflerin son kullanma tarihinden sonra kullanmayın. Testi süre ve sıcaklık aralıklarının dışında gerçekleştirmek geçersiz sonuçlara neden olabilir. Belirlenmiş süre ve sıcaklık aralıklarına girmeyen testler geçersizdir ve tekrarlanmalıdır. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 15 digene HPV Genotyping PS Testi işlemi, test kalibrasyonu, kalite kontrol ve sonuçların yorumlanmasına güvenilir test sonuçları elde etmek açısından kesin olarak uyulmalıdır. Tam reaktif hacmini pipetlemek ve her reaktif eklendikten sonra iyice karıştırmak önemlidir. Aksi halde hatalı test sonuçları oluşabilir. Belirtilen renk değişikliklerinin olmasını sağlamak bu koşulların karşılandığını doğrular. Kit bileşenleri bir ünite olarak test edilmiştir. Başka kaynaklardan veya farklı lotlardan bileşenleri birbirleriyle değiştirmeyin. Nükleik asitler çevresel nükleaz degradasyonuna çok duyarlıdır. İnsan cildinde ve insanların kullandığı materyal yüzeylerinde nükleazlar bulunur. Tüm test adımlarını gerçekleştirirken çalışma yüzeylerini temizleyin tek kullanımlık bir tezgah örtüsüyle örtün ve tek kullanımlık, pudrasız eldivenler giyin. Servikal örnekler, numunelerdeki renk değişikliğini maskeleyebilen kan veya başka biyolojik materyal içerebilir. Koyu renk gösteren numuneler belirtilen renk değişikliğini vermeyebilir. Bu durumda renk değişikliğinin görülmemesi test sonuçlarını etkilemez. Kontrollerde renk değişikliğini gözleyerek uygun karıştırmayı doğrulayın. Test yapılırken yakalama mikroplakası ve DR2'nin eksojen alkalen fosfatazla kontaminasyonunu önlediğinizden emin olun. Alkalen fosfataz içerebilen maddeler arasında DR1, bakteriler, tükürük, saç ve ciltten yağlar vardır. Yakalama mikroplakasını yıkama adımından sonra ve DR2 inkübasyonu sırasında örtmek, eksojen alkalen fosfataz DR2 ile reaksiyona girebilip yalancı pozitif sonuçlar verebileceğinden özellikle önemlidir. DR2'yi doğrudan ışığa uzun süreli maruz kalmadan koruyun. DR2'yi bölüntü oluşturmadan hemen sonra kullanın ve doğrudan güneş ışığından kaçının. Tekrarlayan pozitif displasman pipetinden reaktif iletiminden önce sıvı geçirin ve düzenli olarak büyük hava kabarcıkları açısından kontrol yapın. Pipet ucunda fazla miktarda büyük hava kabarcığı hatalı iletime neden olabilir ve pipeti doldurup tüm sıvıyı dışarı verip tekrar doldurmakla bundan kaçınılabilir. Spesifik kullanma talimatı için pipet kullanıcı el kitabına başvurun. DR1 ve DR2 vermek için ters pipetleme tekniğini kullanarak çoklu kanal pipetleme yapın (bakınız “Protokol 4: Hibrid saptama”, sayfa 34). Çoklu 16 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı kanal pipetinde her pipet ucunu uygun oturma ve dolma açısından kontrol edin. Her yakalama mikroplakası kuyusunun iyice yıkandığından emin olun (bakınız “Protokol 5: Yıkama”, sayfa 36). Yetersiz yıkama artmış arka alan bulgularına yol açar ve yalancı pozitif sonuçlara neden olabilir. Yakalama mikroplakası kuyularında kalan yıkama tamponu azalmış sinyal veya zayıf tekrar üretilebilirliğe yol açabilir. Reaktif Saklama ve Muamele Kit bileşenleri Alındığında kiti 2–8ºC'de saklayın. Yıkama Tamponu x15, Denatürasyon Reaktifi ve Gösterge Boyası istenirse oda sıcaklığında (15–30ºC) saklanabilir. Denatürasyon reaktifi (DNR) prob karışımları ve yıkama tamponu hariç tüm reaktifler kullanıma hazır bir şekilde sağlanır. Hazırlanan reaktifler Hazırlandıktan sonra DNR 2–8ºC'de 3 ay stabildir. Hazırlandıktan sonra yıkama tamponu 2–30ºC'de 3 ay stabildir. Numune Toplama ve Hazırlama digene HPV Genotyping PS Testi için test yapılmak üzere servikal örnekleri aşağıdaki numune toplama cihazlarından birini kullanarak toplayın ve nakledin: digene HC2 DNA Collection Device [bir servikal fırça ve Örnek Taşıma Ortamından (Sample Transport Medium, STM) oluşur] PreservCyt Solüsyonuna yerleştirilen süpürge tipi bir toplama cihazı veya fırça/spatül kombinasyon toplama cihazı Diğer toplama cihazlarıyla toplanan numuneler veya başka taşıma ortamlarında taşınan numuneler bu testte kullanılmak üzere doğrulanmamıştır. Bu testin performans özellikleri sadece belirtilen toplama cihazlarıyla belirlenmiştir. Ek numune toplama ve muamele işlemleri için digene HC2 DNA Collection Device kullanma talimatına başvurun. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 17 STM'de servikal örnekler STM içinde toplanan servikal örnekler için digene HPV Genotyping PS Testiyle test yapılması öncesinde örnek hazırlığı gerekmez. digene HPV Genotyping PS Testi, digene HC2 High-Risk HPV DNA Testi için bir refleks olduğundan STM örnekleri daha önce denatüre edilmiş olacaktır ve testte “Protokol 2: Prob karışımı ekleme” kısmına ilerlemeye hazırdır. digene HPV Genotyping PS Testini yapmak her denatüre STM numunesinden en az 225 µl bulunmalıdır. PreservCyt Solüsyonu içinde servikal numuneler PreservCyt örnekler için digene HPV Genotyping PS Testiyle test yapılması öncesinde örnek hazırlığı gerekir. Numuneleri rutin şekilde alın ve ThinPrep® Pap Testi lamlarını üretici tarafından sağlanan talimata göre hazırlayın. Toplama sonrasında PreservCyt numunelerini digene HPV Genotyping PS Testi için örnek hazırlama öncesinde 2–30ºC'de 3 aya kadar saklayın. PreservCyt numuneleri dondurulamaz. digene HC2 Sample Conversion Kiti kullanarak örnek hazırlamanın sonucu testte “Protokol 2: Prob karışımı ekleme” kısmına ilerlemeye hazır bir denatüre örnektir. 18 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı İşlem Başlamadan önce yapılacaklar İnkübatör sallayıcının soğuk başlangıçtan 55°C ± 2ºC'ye dengelenmesi için en az 60 dakika bekleyin. Bu ısınma süresini beklememek hatalı test sonuçlarına neden olabilir. Su banyosunun 65ºC'de olduğundan ve su düzeyinin tüplerdeki tüm sıvı hacmini batırmaya yeterli olduğundan emin olun. Yeni bir “Test Verileri Kayıt Çalışma Sayfası” yazdırın ve şu bilgileri kaydedin (bakınız “Ek B: Test Verileri Kaydetme Çalışma Sayfası”, sayfa 64): Test yeri Test tarihi Kullanıcı Kimliği Çevre sıcaklığı digene HPV Genotyping PS Test kiti lot numarası Kontroller ve örnekler bir 8 mikroplaka kuyusu sütun konfigürasyonunda çalışılır. “Test Verileri Kayıt Çalışma Sayfasını” mikroplaka kuyusu konumlarındaki tüm gerekli kontroller ve örneklerin kimliklerini kaydederek doldurun. Her test için kontroller mikroplakada şu pozisyonlarda test edilmelidir (bakınız aşağıda Şekil 1): Negatif Kontrol 1 (NC1) replikatları mikroplaka kuyuları A1, B1 ve C1 içinde Pozitif Kontrol 1 (PC1) replikatları mikroplaka kuyuları D1, E1 ve F1 içinde Negatif Kontrol 2 (NC2) ve prob karışımı 16 mikroplaka kuyusu G1 içinde NC2 ve prob karışımı 18 mikroplaka kuyusu H1 içinde NC2 ve prob karışımı 45 mikroplaka kuyusu A2 içinde Pozitif Kontrol 2 (PC2) ve prob karışımı 16 mikroplaka kuyusu B2 içinde PC2 ve prob karışımı 18 mikroplaka kuyusu C2 içinde PC2 ve prob karışımı 45 mikroplaka kuyusu D2 içinde digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 19 Örnek Şekil 1. Mikroplakada kontroller ve örneklerin pozisyonu. 20 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Reaktif hazırlama Başlamadan önce önemli noktalar Herhangi bir önceden denatüre edilmiş numuneler ve reaktifleri oda sıcaklığına dengelemeden önce PreservCyt numunelerini hazırlayın. Numuneleri ve tüm gereken reaktifleri depodan teste başlamadan önce çıkarın. 15–30 dakika boyunca 20–25ºC'ye gelmelerini bekleyin. Tüm hazırlanmış reaktifleri (aksi belirtilmedikçe) ve reaktif bölüntülerini test sonunda atın. Test sayısına bağlı olarak her reaktif için gerekli hacmi belirlemek için aşağıda Tablo 1 kısmını kullanın. Tablo 1. Hazırlanan ve kullanıma hazır reaktiflerin gereken hacimleri Test/strip sayısı* HPV 16 prob karışımı HPV 18 prob karışımı HPV 45 prob Yıkama karışımı tamponu 4/5 0,77 ml 0,56 ml 0,56 ml 8/5 0,91 ml 0,70 ml 12/8 1,05 ml 16/8 DR1 DR2 >1 litre 2,55 ml 2,55 ml 0,70 ml >1 litre 3,45 ml 3,45 ml 0,84 ml 0,84 ml >1 litre 4,35 ml 4,35 ml 1,19 ml 0,98 ml 0,98 ml >1 litre 5,25 ml 5,25 ml 20/11 1,33 ml 1,12 ml 1,12 ml >1 litre 6,15 ml 6,15 ml 24/11 1,47 ml 1,26 ml 1,26 ml >1 litre 7,05 ml 7,05 ml 28/12 1,61 ml 1,40 ml 1,40 ml >1 litre 7,95 ml 7,95 ml * Test/strip sayısı HPV tip 16, 18 ve 45 için bir numunenin test edilmesini temel alır ve kontroller için gerekli reaktif miktarını içerir. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 21 Yakalama Mikroplakası Yakalama mikroplakası bir plaka çerçevesinde 12 adet sekiz kuyulu yakalama kuyusu stripi içerir. Test sırasında kullanılmayan her yakalama mikroplakası kuyusunun plaka çerçevesinden çıkarılıp tekrar folyo ambalaja konması ve ek testlerde kullanılabilmek üzere saklanması gerekir. 1. Bir gazlı kalemle yakalama mikroplakasını uygun bir tanımlayıcıyla etiketleyin. 2. Doldurulmuş Test Verileri Kayıt Çalışma Sayfasına göre gereken yakalama mikroplaka kuyusu sayısını belirleyin. 3. Yakalama mikroplakasını temiz KimTowels kağıt havluları veya eşdeğer az tiftikli kağıt havlu üzerine yerleştirin. 4. Eldivenli bir parmak veya kalem üzerindeki silgiyi kullanarak kullanılmayacak yakalama mikroplaka kuyusu striplerini plaka çerçevesinden itin. 5. Çıkarılmış yakalama mikroplaka kuyusu striplerini tekrar folyo ambalaja koyun, kapatın ve saklayın. Not: Yakalama mikroplakası 2–8ºC'de saklanır. Denatürasyon reaktifi Denatürasyon Reaktifini kullanırken dikkatli olun. Uyarılar ve önlemler için bakınız sayfa 13. 1. Denatürasyon Reaktifi şişesine 2 damla Gösterge Boyası ekleyin. 2. DNR'yi iyice karıştırın. DNR homojen bir koyu mor renge sahip olmalıdır. 3. DNR'yi yeni son kullanma tarihiyle etiketleyin. Notlar: Hazırlandıktan sonra DNR 2–8ºC'de 3 ay stabildir. Renk solarsa, 1 damla daha Gösterge Boyası ekleyin ve kullanmadan önce iyice karıştırın. Prob karışımları Her numuneyi HPV tip 16, 18 ve 45 için test etmek her tip için belirli bir prob karışımı ve numune başına toplam 3 prob karışımı gerektirir. 8 kontrol mikroplaka kuyusu için kullanıldığından ek HPV 16 prob karışımı miktarı 22 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı gerekir. Her biri 2 kontrol mikroplaka kuyusu için kullanıldığından ek HPV 18 ve HPV 45 prob karışımları gerekir. Her prob karışımını aşağıda tanımlandığı şekilde ayrı olarak hazırlayın. Başlamadan önce önemli noktalar Prob karışımlarını “Protokol 1: Denatürasyon” sırasında hazırlayın (bakınız sayfa 27). RNaz kontaminasyonunu önlemek için çok dikkatli olun. Probu pipetlerken aerosol bariyeri pipet uçları kullanın. Prob Seyreltici visközdür. Prob karışımlarını hazırlarken görünür bir vorteks elde edildiğinden emin olun; tam olmayan karıştırma azalmış sinyale neden olabilir. 1. Probun flakon şişesine sıkışmasını önlemek için her prob flakonunu flakon alt kısmına sıvı getirmek üzere kısa süre santrifüje edin. 2. Karıştırmak için flakona hafifçe vurun. 3. 1:24:10 prob seyreltme için gereken hacimleri belirleyin: Prob Seyreltici: %5,5 NP-40, prob karışımını hazırlamak için. Not: Mikroplaka kuyusu başına 35 µl prob karışımı gereklidir. Öneri: Flakon yanında veya pipet uçlarında kaybedilebilecek hacim için ekstra prob karışımı hazırlayın. Önerilen ekstra hacmi içeren önerilen hacimleri (bakınız Tablo 1, sayfa 21) kullanın. 4. Yeni, tek kullanımlık bir kabı uygun şekilde etiketleyin. Test sayısına bağlı olarak 1,5 ml veya 5 ml yuvarlak altlı bir polipropilen tüp önerilir. 5. Gereken miktarda Prob Seyrelticiyi (bakınız aşağıda Tablo 2) etiketlenen tüpe pipetleyin. 6. Gereken miktarda probu Prob Seyrelticiye (bakınız aşağıda Tablo 2) pipet ucunu tüpün iç duvarına karşı menisküsün hemen üzerine yerleştirip içindekileri dışarı vererek pipetleyin. Önemli: Pipet ucunu Prob Seyreltici içine batırmayın. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 23 7. Gereken %5,5 NP-40 miktarını (bakınız aşağıda Tablo 2) etiketlenen tüpe pipetleyin. Tablo 2. Prob karışımı hazırlama Gereken prob karışımı hacmi Prob Seyreltici Hacmi Prob hacmi %5,5 NP-40 hacmi 0,56 ml 384 µl 16 µl 160 µl 0,70 ml 480 µl 20 µl 200 µl 0,77 ml 528 µl 22 µl 220 µl 0,84 ml 576 µl 24 µl 240 µl 0,91 ml 624 µl 26 µl 260 µl 0,98 ml 672 µl 28 µl 280 µl 1,05 ml 720 µl 30 µl 300 µl 1,12 ml 768 µl 32 µl 320 µl 1,19 ml 816 µl 34 µl 340 µl 1,26 ml 864 µl 36 µl 360 µl 1,33 ml 912 µl 38 µl 380 µl 1,40 ml 960 µl 40 µl 400 µl 1,47 ml 1008 µl 42 µl 420 µl 1,61 ml 1056 µl 44 µl 440 µl 8. İyice karıştırmak için maksimum hızda en az 5 saniye vorteksleyin. Görünür bir vorteks oluşmalıdır. 24 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Yıkama tamponu Başlamadan önce önemli noktalar Yıkama tamponunu “Protokol 3: Hibridizasyon ve hibrid yakalama” sırasında hazırlayın (bakınız sayfa 32). Manuel mikroplaka yıkama yöntemi için Yıkama Aygıtında 3 litre yıkama tamponu hazırlayın. Öneri: Bakteri ve küflerde bulunan alkalen fosfatazla olası kontaminasyonu önlemek için 3 ayda bir Yıkama Aygıtı ve tüpü %0,5 sodyum hipoklorür solüsyonuyla yıkayın ve distile veya deiyonize suyla iyice durulayın. Automated Plate Washer için yıkama tamponunu hazırlayıp kapaklı bir kapta saklayın veya 1 litre hazırlayıp Automated Plate Washer yıkama rezervuarına yerleştirin. 1. Yıkama Tamponu x15 kuyusunu karıştırın ve gerekli Yıkama Tamponu x15 hacmini (bakınız aşağıda Tablo 3) belirtilen kaba ekleyin. 2. Gerekli distile veya deiyonize su hacmini (bakınız aşağıda Tablo 3) belirtilen kaba ekleyin. Tablo 3. Yıkama tamponu hazırlama Gerekli yıkama tamponu hacmi Yıkama Tamponu x15 Hacmi Distile veya deiyonize su hacmi 1 litre 67 ml 933 ml 1,5 litre 100 ml 1400 ml 2 litre 133 ml 1867 ml 3 litre 200 ml 2800 ml 3. Kabın herhangi bir açıklığı üzerine temiz, az tiftikli kağıt havlu yerleştirin ve iyice karıştırın. 4. Kabı uygun olduğu şekilde mühürleyin veya ilgili alete yerleştirin. 5. Yıkama tamponunu yeni son kullanma tarihiyle etiketleyin. Not: Hazırlandıktan sonra yıkama tamponu 2–30ºC'de 3 ay stabildir. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 25 Örnek hazırlama PreservCyt örnekler için digene HPV Genotyping PS Testiyle test yapılması öncesinde örnek hazırlığı gerekir. digene HPV Genotyping PS Testi HPV tip 16, 18 ve 45 testi yapmak için 225 µl hazırlanmış örnek gerektirir. Bu testi yapmak için uygun şekilde saklanmış ve daha önce hazırlanmış PreservCyt örnekleri kullanılabilir. Yetersiz miktarda hazırlanmış PreservCyt örneği varsa testi yapmak için minimum 6 ml PreservCyt numunesi hazırlanmalıdır. PreservCyt numuneleri için manuel örnek hazırlama açısından digene HC2 Sample Conversion Kiti kullanma talimatına başvurun. digene HC2 Sample Conversion Kiti kullanarak örnek hazırlamanın sonucu testte “Protokol 2: Prob karışımı ekleme” kısmına ilerlemeye hazır bir denatüre örnektir (bakınız sayfa 29). Kontrolleri “Protokol 1: Denatürasyon” uyarınca ayrı olarak hazırlayın (bakınız sayfa 27). 26 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Protokol 1: Denatürasyon digene HPV Genotyping PS Testi için gerekli kontroller aşağıdaki talimata göre denatüre edilir. Başlamadan önce önemli noktalar STM numunelerini “Protokol 1: Denatürasyon” uyarınca denatüre etmeyin. STM numuneleri daha önce digene HC2 High-Risk HPV DNA Testiyle test yapılmasının sonucu olarak denatüre edilmiştir ve testte “Protokol 2: Prob karışımı ekleme” kısmına ilerlemeye hazırdır. PreservCyt numuneleri veya örneklerini “Protokol 1: Denatürasyon” uyarınca denatüre etmeyin. PreservCyt numunelerinin denatürasyonu örnek hazırlamanın bir parçası olarak yapılır. Hazırlanmış PreservCyt örnekleri testte “Protokol 2: Prob karışımı ekleme” kısmına ilerlemeye hazırdır. Bu protokolü uygularken kontrolleri dökmemeye veya DNR'yi sıçratmamaya dikkat edin. DNR'nin kontrol tüpüne eklenmesi sıvı en üste yakın olacak şekilde tüpü doldurur. Uyarılar ve önlemler için bakınız sayfa 13. Başlamadan önce yapılacaklar Su banyosunda tüplerin tüm hacmini batırmaya yeterli su olduğundan emin olun. Yalancı pozitif sonuçlardan kaçınmak için tüm kontrol materyalinin DNR ile temas etmesi çok önemlidir. 1. NC1, PC1, NC2 ve PC2 kapaklarını etiketleyin. Kapaklar kontrol tüplerini kapatmak için tekrar kullanılacaktır. 2. NC1, PC1, NC2 ve PC2'den kapakları çıkarın ve kapakları olası kontaminasyondan uzağa yerleştirin. 3. Her ekleme için yeni bir pipet ucuyla tek kanallı bir pipet kullanarak her kontrol tüpüne 500 µl DNR'yi pipet ucunu sıvı yüzeyinin altına yerleştirip verme yoluyla verin. 4. Her ilgili kontrole kapağı tekrar takın ve tüpü kapatın. Kontaminasyon veya dökülmeden kaçınmak için kapakların çevrilerek sıkıca kapatıldığından emin olun. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 27 5. Her tüpü puls vorteksleme ile ayrı ayrı yüksek hızda en az 30 saniye iyice karıştırın. Önemli: DNR eklemekten sonra karıştırma kritik bir adımdır. 6. Tüpleri 65 ± 2ºC su banyosunda 45 ± 5 dakika yüzen bir mikrosantrifüj tüp askısı içinde inkübe edin. Bu inkübasyon sırasında gereken prob karışımlarını hazırlayın (bakınız “Reaktif hazırlama” sayfa 21). 7. İnkübasyondan sonra tüpleri su banyosundan çıkarın. Denatüre edilmiş kontrollere şunlar yapılabilir: Hemen test edilebilirler (“Protokol 2: Prob karışımı ekleme” sayfa 29 kısmına ilerleyin) Saklanabilirler (bakınız “İsteğe bağlı durma noktası” sayfa 28) İsteğe bağlı durma noktası Önemli: Denatüre numuneler veya kontrolleri kuru buzda saklamayın veya göndermeyin. Denatüre edilmiş kontroller 2–8ºC'de gece boyunca veya aşağıdakilere göre –20ºC'de saklanabilir: 4 haftaya kadar saklama için maksimum bir dondurma/çözme döngüsü yapılabilir. 9 güne kadar saklama için maksimum 3 dondurma/çözme döngüsü yapılabilir. Her dondurma/çözme döngüsü için çözme döngüsü sırasında oda sıcaklığında maksimum 2 saat beklenebilir. 28 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Protokol 2: Prob karışımı ekleme Başlamadan önce önemli noktalar Prob karışımı visközdür. Prob karışımının iyice karıştırıldığından ve her hibridizasyon mikroplaka kuyusuna gerekli miktarın tamamen verildiğinden emin olun. Kontroller ve örnekleri hibridizasyon mikroplakasına aktarırken şunlara uyun: Örnekler dikkatli şekilde aktarılmazsa yalancı pozitif sonuçlar oluşabileceğinden hibridizasyon mikroplakası kenarlarına dokunmaktan kaçının. Hava kabarcıklarının oluşumunu sınırlayın. Çapraz kontaminasyondan kaçınmak açısından her aktarma için temiz, ekstra uzun bir pipet ucu kullanın. Başlamadan önce yapılacaklar Denatüre edilmiş kontroller veya örnekler saklanmışsa 20–25ºC'ye dengelenmelerini bekleyin. STM veya PreservCyt örnekleri bir örnek askısında saklanmışsa ve vorteksleme için MST Vortexer 2 kullanılacaksa tüplerden kapakları çıkarın ve atın. 1. Bir hibridizasyon mikroplakası alıp etiketleyin. 2. Kontrol ve örnek tiplerini aşağıdaki yöntemlerden birini kullanarak vorteksleyin: Vorteksleyici ile herhangi bir örnek tüpü Her tüpü ayrı olarak maksimum hız ayarında en az 5 saniye vorteksleyin. MST Vortexer 2 ile STM örnekleri a. Geçerli olduğu şekilde tüpleri DuraSeal tüp mühürleyici filmle kapatın ve askı kapağını numune askısında sabitleyin. b. Numune askısını maksimum hız ayarında en az 5 saniye vorteksleyin. c. Numune askısını hemen tezgah üstüne koyun ve sürgüleri serbest bırakın. Askı kapağını yaklaşık 1 cm kaldırın ve DuraSeal tüp mühürleyici filme yapışmış olabilecek herhangi bir tüpü serbest bırakmak üzere hafifçe sola ve sağa hareket ettirin. Askı kapağını digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 29 numune askısından açıkta oluncaya kadar düz yukarı kaldırarak çıkarın. d. DuraSeal tüp mühürleyici filmi askı kapağından dikkatle soyarak çıkarın ve atın. MST Vortexer 2 ile PreservCyt örnekleri a. Geçerli olduğu şekilde tüpleri DuraSeal tüp mühürleyici filmle kapatın ve askı kapağını numune askısında sabitleyin. b. Numune askısını maksimum hız ayarında en az 10 saniye vorteksleyin. c. Numune askısını hemen tezgah üstüne koyun ve sürgüleri serbest bırakın. Askı kapağını yaklaşık 1 cm kaldırın ve DuraSeal tüp mühürleyici filme yapışmış olabilecek herhangi bir tüpü serbest bırakmak üzere hafifçe sola ve sağa hareket ettirin. Askı kapağını numune askısından açıkta oluncaya kadar düz yukarı kaldırarak çıkarın. d. DuraSeal tüp mühürleyici filmi askı kapağından dikkatle soyarak çıkarın ve atın. 3. Ekstra uzun pipet uçlu tek kanallı bir pipet kullanarak her kontrol veya örnekten 75 µl miktarını Test Verileri Kayıt Çalışma Sayfasına göre boş hibridizasyon mikroplakasının altına aktarın. Geçerli olduğu şekilde kalan hacmi aşağıdaki talimata göre saklayın: Denatüre edilmiş kontrollere orijinal kapakları tekrar takın ve “İsteğe bağlı durma noktası”, sayfa 28 içinde ayrıntıları verilen sınırlara göre saklayın. STM örneklerine yeni numune toplama tüpü vidalı kapakları takın ve digene HC2 High-Risk HPV DNA Testi kullanma talimatındaki talimata göre saklayın. PreservCyt örneklerine yeni bir kapak takın ve digene HC2 Sample Conversion Kiti kullanma talimatındaki talimata göre saklayın. 4. Son örneği aktardıktan sonra hibridizasyon mikroplakasını bir mikroplaka kapağıyla örtün ve 20–25ºC'de 10 dakika inkübe edin. 5. Prob karışımlarını iyice vorteksleyin. 30 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 6. Uygun prob karışımından 35 µl miktarını tek kanallı veya tekrarlayan pozitif displasman pipeti ve her prob karışımı ekleme için yeni bir uç kullanarak her hibridizasyon mikroplaka kuyusuna dikkatle pipetleyin. Geriye sıçramadan ve hibridizasyon mikroplaka kuyularının kenarlarına dokunmaktan kaçının. 7. Hibridizasyon mikroplakasını bir mikroplaka kapağı veya plaka mühürleyici ile örtün ve Rotary Shaker I aletinde 800 ± 100 devir/dk hızında 3 ± 2 dakika sallayın. 8. Hibridizasyon mikroplakasını Rotary Shaker I aletinden çıkarın. Mikroplaka kapağını çıkarın ve temiz bir yüzeye koyun. Salladıktan sonra kontroller ve STM örnekleri sarıya dönmeli ve PreservCyt örnekleri pembeye dönmelidir. Mor kalan örnekler uygun miktarda prob karışımı olmamış olabilir. Mor kalan örneklere uygun prob karışımından 35 µl daha ekleyin ve Rotary Shaker I aletinde 800 ± 100 devir/dk hızında 3 ± 2 dakika daha sallayın. Bir örnek bu işlemden sonra mor kalırsa numuneyi tekrar test edin. 9. “Protokol 3: Hibridizasyon ve hibrid yakalama”, sayfa 32 kısmına ilerleyin. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 31 Protokol 3: Hibridizasyon ve hibrid yakalama 1. Hibridizasyon mikroplakasını yakalama mikroplakasının yanına yerleştirin. 2. 8 kanallı bir pipet kullanarak hibridizasyon plaka kuyularının tüm içeriğini (yaklaşık 110 µl) karşılık gelen yakalama mikroplakası kuyularının altına aktarın. Her transfer için yeni pipet uçları kullanın ve tam örnek transferi sağlamak üzere her pipet ucunun boşalmasını bekleyin. İsterseniz pipeti pipet uçlarının ortasını yakalama mikroplaka kuyularının üst kenarına dayayarak sabitleyin (bakınız aşağıda Şekil 2) Not: Az miktarda örnek için 8 kanallı pipet yerine 20–200 µl pipet uçlu tek kanallı bir pipet kullanılabilir. Her transfer için yeni pipet uçları kullanın. Doğru Geriye sıçramadan kaçınmak için dikey pipetlemeyin. Pipet ucunun mikroplaka kuyusunun yanına dokunmasına izin vermeyin. Şekil 2. Doğru pipetleme tekniği. 3. Yakalama mikroplakasını yeni bir plaka mühürleyici ile örtün ve yakalama mikroplakasını 1100 ± 100 devir/dk hızıyla 120 ± 5 dakika 55 ± 2ºC'ye dengelenmiş bir inkübatör sallayıcıda inkübe edin. 4. İnkübasyon tamamlandığında yakalama mikroplakasını inkübatör sallayıcıdan çıkarın ve plaka mühürleyiciyi dikkatle çıkarın. 32 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 5. Sıvıyı yakalama mikroplaka kuyularından bir lavaboya dökerek giderin; yakalama mikroplakasını lavabo üzerinde tamamen ters çevirin ve aşağıya doğru bir hareketle iyice sallayın. Önemli: Plakayı tekrar düz çevirmeyin. Lavabonun altına çok yakından dökerek geri sıçramaya neden olmadığınızdan emin olun. 6. Temiz KimTowels kağıt havluları veya eşdeğer az tiftikli kağıt havlu ile 2–3 kez sıkıca dokunarak sıvıyı giderin. Yakalama mikroplaka kuyularından tüm sıvının giderildiğinden ve yakalama mikroplakasının üstünün kuru olduğundan emin olun. 7. “Protokol 4: Hibrid saptama”, sayfa 34 kısmına ilerleyin. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 33 Protokol 4: Hibrid saptama Başlamadan önce önemli noktalar 8 kanallı bir pipet kullanarak soldan sağa yönde yakalama mikroplakası boyunca reaktif eklemelerini yapın. Yakalama mikroplakasına iletmeden önce fazla reaktifi gidermek için pipet uçlarını tek kullanımlık reaktif rezervuarında silin. 8 kanallı pipet kullanılmıyorsa, uygun bir tekrarlayan pozitif displasman pipeti onun yerine kullanılabilir. DR1'i gerekli hacmi tutmaya yetecek büyüklükte bir polipropilen tüp içine bölüntüleyin. Reaktif iletme tutarlılığını arttırmak üzere ters pipetleme tekniğinin kullanılması önerilir. İşlem aşağıda tanımlanmıştır. İsterseniz pipeti pipet uçlarının ortasını yakalama mikroplaka kuyularının üst kenarına dayayarak sabitleyin. Numunelerin çapraz kontaminasyonu oluşabileceğinden yakalama mikroplaka kuyularının yanlarına dokunmadığınızdan emin olun (bakınız Şekil 2, sayfa 32). 1. DR1'i iyice karıştırın ve uygun hacmi (bakınız Tablo 1, sayfa 21) temiz, tek kullanımlık bir reaktif rezervuarına dikkatle ölçüp koyun. 2. Her yakalama mikroplaka kuyusuna ters pipetleme tekniğini kullanarak aşağıdaki gibi 75 µl DR1'i dikkatle pipetleyin: a. 8 kanallı pipete uçları takın; tüm uçların sıkıca oturduğundan emin olun. b. Pipet pistonunu birinci durma noktasının ötesine ikinci durma noktasına itin. c. Uçları reaktife batırın. d. Pistonu yavaşça serbest bırakın ve reaktifin uçları doldurmasını bekleyin. e. Reaktifi mikroplaka kuyularına pistonu birinci durma noktasına iterek verin. Pistonu pipet uçları tekrar reaktif içine batmadan serbest bırakmayın. f. Tüm mikroplaka kuyuları doluncaya kadar uçları tekrar doldurun ve tekrarlayın. Pembe renk şiddetini gözleyerek tüm yakalama mikroplaka kuyularının dolduğunu doğrulayın. Tüm yakalama mikroplaka kuyularında benzer bir pembelik şiddeti olmalıdır. 34 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 3. Yakalama mikroplakasını bir mikroplaka kapağı, temiz Parafilm veya eşdeğeriyle örtün ve 20–25ºC'de 30–35 dakika inkübe edin. 4. “Protokol 5: Yıkama”, sayfa 36 kısmına ilerleyin. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 35 Protokol 5: Yıkama Yakama mikroplakasını aşağıdaki yöntemlerden birini kullanarak yıkayın. Automated Plate Washer yöntemi Automated Plate Washer'ın gücünü daima AÇIK olarak tutun. Automated Plate Washer sistemi temizlemek için rutin olarak durular. Daha ileri talimat için Otomatik Plaka Yıkayıcı Kullanıcı El Kitabına (Automated Plate Washer User Manual) başvurun. Başlamadan önce yapılacaklar Yıkama rezervuarının en az 1 litre yıkama tamponuyla doldurulmuş olduğunu doğrulayın. Değilse, yıkama tamponunu hazırlayın (bakınız “Reaktif hazırlama”, sayfa 21). Durulama rezervuarının deiyonize veya distile suyla doldurulmuş olduğunu doğrulayın. Atık rezervuarının boş ve kapağın sıkıca takılmış olduğunu doğrulayın. Automated Plate Washer her yıkamadan önce otomatik olarak sıvı doldurur ve her yıkamadan sonra durulama yapar. Automated Plate Washer sadece tam stripleri yıkar ve kuyuları veya stripleri atlayamaz. Sadece kısmi bir yakalama mikroplaka kuyusu stripi kullanılıyorsa, yıkama öncesinde stripi tamamlamak için boş mikroplaka kuyularını plaka çerçevesine yerleştirin. Yıkanan tüm striplerde mikroplaka kuyuları bulunmalıdır. 1. Yakalama mikroplaka kapağı, temiz Parafilm veya eşdeğerini çıkarın ve yakalama mikroplakasını Automated Plate Washer platformuna yerleştirin. 2. Automated Plate Washer'ın AÇIK olduğunu ve ekranın “Digene Wash Ready” (Digene Yıkamaya Hazır) veya “P1” gösterdiğini doğrulayın. 3. Yıkanacak strip sayısını “Rows” (Sıralar) sütununa basıp ayarlamak için seçin ve “+” veya “–” kullanın. 4. “Digene Wash Ready” veya “P1” kısmına dönmek için “Rows” tuşuna basın. 36 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 5. Başlamak için “Start/Stop” (Başlat/Durdur) kısmına basın. Automated Plate Washer her döngü yaklaşık 10 dakika sürecek şekilde 6 doldurma ve aspirasyon döngüsü gerçekleştirecektir. Program sırasında kısa süre duraklama olacaktır; yakalama mikroplakasını erken çıkarmayın. Automated Plate Washer yıkaması bittiğinde “Digene Wash Ready” veya “P1” gösterecektir. 6. Program bittiğinde yakalama mikroplakasını Automated Plate Washer platformundan çıkarın. Yakalama mikroplaka kuyuları beyaz kalmalı ve yakalama mikroplaka kuyularında kalan pembe sıvı bulunmamalıdır. 7. “Protokol 6: Sinyal amplifikasyonu”, sayfa 39 kısmına ilerleyin. Manuel Plaka Yıkama Başlamadan önce yapılacaklar: Yıkama Aygıtının en az 1 litre yıkama tamponuyla doldurulmuş olduğunu doğrulayın. 1. Yakalama mikroplakası kapağı, temiz Parafilm veya eşdeğerini çıkarın. 2. Yakalama mikroplakasının üstüne temiz KimTowels kağıt havluları veya eşdeğer az tiftikli kağıt havlu üzerine yerleştirin. 3. Kağıt havluların yakalama mikroplakasının tüm yüzey alanına temas ettiğinden emin olun ve yakalama mikroplakasını dikkatle ters çevirin. 4. Yakalama mikroplakasının 1–2 dakika boşalmasını bekleyin. 5. Yakalama mikroplakasını temiz KimTowels kağıt havluları veya eşdeğer az tiftikli kağıt havlu üzerinde dokunarak sıvıyı giderin. Alkalen fosfataz kontaminasyonundan kaçınmak için kullanılmış kağıt havluları dikkatle atın. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 37 6. Yıkama Aygıtını kullanarak yakalama mikroplakasını manuel olarak 6 kez yıkayın. Uygun şekilde yıkamak için her yakalama mikroplakası kuyusunu yıkama tamponuyla taşacak şekilde doldurun. Bu işlem yakalama mikroplaka kuyularının üstlerinden DR1'i giderecektir. Yıkama yakalama mikroplakası A1'de başlar ve sağa ve aşağıya olmak üzere yılan şeklinde devam eder. Tüm yakalama mikroplaka kuyuları dolduğunda sıvıyı lavaboya kuvvetli aşağıya doğru hareketle boşaltın. İkinci yıkama yakalama mikroplaka kuyusu H12'de başlar ve sola ve yukarıya yılan gibi hareketle devam eder. Bu 2 yıkama dizisi 2 kez daha tekrarlanarak tolam 6 yakalama mikroplakası yıkanması yapılır. 7. Yıkanma sonrasında yakalama mikroplakasını temiz KimTowels kağıt havluları veya eşdeğer az tiftikli kağıt havlu üzerine ters çevirerek ve 3–4 kez kuvvetle vurarak sıvıyı giderin. Kağıt havluları değiştirip tekrar sıvıyı giderin. 8. Yakalama mikroplakası ters çevrilmiş olarak 5 dakika boşalmasını bekleyin. Kağıt havluları değiştirip tekrar sıvıyı giderin. Yakalama mikroplakası beyaz görünmeli ve yakalama mikroplaka kuyularında kalan pembe sıvı bulunmamalıdır. 9. “Protokol 6: Sinyal amplifikasyonu”, sayfa 39 kısmına ilerleyin. 38 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Protokol 6: Sinyal amplifikasyonu Başlamadan önce önemli noktalar DR2 kullanmak için yeni bir pudrasız, tek kullanımlık eldiven çifti kullanın. 8 kanallı bir pipet kullanarak soldan sağa yönde yakalama mikroplakası boyunca reaktif eklemelerini yapın. 8 kanallı pipet kullanılmıyorsa, uygun bir tekrarlayan pozitif displasman pipeti onun yerine kullanılabilir. DR2'yi gerekli hacmi tutmaya yetecek büyüklükte bir polipropilen tüp içine bölüntüleyin. DR2'yi kesintisiz olarak ekleyin. Tüm yakalama mikroplaka kuyularının inkübasyon süresi mümkün olduğunca aynı olmalıdır. Numunelerin çapraz kontaminasyonu oluşabileceğinden yakalama mikroplaka kuyularının yanlarına dokunmamaya veya pipet uçlarına reaktif sıçratmamaya dikkat edin (bakınız Şekil 2, sayfa 32). 1. DR2'yi iyice karıştırın ve uygun hacmi (bakınız Tablo 1, sayfa 21) temiz, tek kullanımlık bir reaktif rezervuarına ölçüp koyun. 2. Her mikroplaka kuyusuna daha önce tanımlanan ters pipetleme tekniğini kullanarak 75 µl DR2 pipetleyin (bakınız “Protokol 4: Hibrid saptama”, sayfa 34). Sarı renk şiddetini gözleyerek tüm yakalama mikroplaka kuyularının doğru şekilde doldurulduğunu doğrulayın; tüm yakalama mikroplaka kuyularının benzer bir sarılık şiddeti olmalıdır. 3. Yakalama mikroplakasını bir mikroplaka kapağıyla örtün ve 20–25ºC'de 15 dakika inkübe edin (en fazla 30 dakika inkübasyon). Doğrudan güneş ışığından kaçının. 4. “Protokol 7: Yakalama mikroplakalarını ölçme ve sonuç oluşturma”, sayfa 40 kısmına ilerleyin. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 39 Protokol 7: Yakalama mikroplakalarını ölçme ve sonuç oluşturma 1. İnkübasyon tamamlandıktan sonra yakalama mikroplakasını DML aletinin ham veri ölçme işlemini kullanarak ölçün. Bir yakalama mikroplakasını ölçmenin ayrıntıları için ilgili yazılım kullanıcı el kitabına başvurun. 2. Ham veri raporunu yazdırın. Önemli: Ham veri raporu ölçümden sonra yazdırılmalıdır. Ham veri raporu digene test analiz yazılımı kullanılarak kaydedilemez. 3. Ham veri raporunu Test Verileri Kayıt Çalışma Sayfası içinde belirtilen bilgiyi kullanarak uygun şekilde etiketleyin. 4. Bir ham yakalama mikroplakası kullanılmadıysa, kullanılmış yakalama mikroplaka kuyularını plaka çerçevesinden çıkarın, plaka çerçevesini distile veya deiyonize suyla iyice durulayın, kurutun ve sonraki test için ayırın. 5. Tüm kullanılmış bölüntüler ve hazırlanmış reaktifleri aksi belirtilmedikçe atın. 40 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Sonuçların Yorumlanması digene HPV Genotyping PS Testi kesme noktası (CO) HPV 16, 18, 45 plasmidlerinin 5.000 kopyasına karşılık gelir. Önemli: Test sonuçları yorumlanmadan önce tüm kalite kontrol ve test kalibrasyonu doğrulama gerekliliklerini tamamlayın (bakınız “Kalite Kontrol”, sayfa 50). Test sonuçları Pozitif numuneleri belirlemek için CO, PC1 ortalamasıdır. Test kalibrasyonu doğrulama sırasında hesaplanmış PC1 ortalamasını kullanarak her numune için RLU/CO değerini belirleyin. Test sonuçları şöyle belirlenir: RLU/CO değeri ≥2,0 olan örnekler o HPV tipi için “pozitif” kabul edilir. RLU/CO değeri <2,0 olan örnekler o HPV tipi için “negatif” veya “no HPV DNA detected” (HPV DNA saptanmadı) kabul edilir. HPV DNA sekansları yoktur veya HPV DNA düzeyleri testin saptama sınırının altındadır. Sorun Giderme kılavuzu Açıklama ve öneriler Kontrollerin denatürasyonu sırasında uygun renk değişikliği gözlenmemesi veya hiç renk değişikliği olmaması a) DNR yanlış hazırlanmıştır DNR'nin Gösterge Boyayı içerdiğinden ve koyu mor renkte olduğundan emin olun. b) DNR kontrolleri eklenmemiştir DNR'nin kontrollere eklendiğini mikroplakadaki hacmi ölçerek doğrulayın. Hacim 75 µl olmalıdır. Hacim DNR'nin eklenmediğine işaret ederse, uygun DNR eklemesini yapın, karıştırın ve uygun renk değişikliği gözlenirse teste devam edin. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 41 Açıklama ve öneriler Kalite kontroller hatalı sonuçlar verir Kontrollerin mikroplakaya hatalı yerleştirilmesi “Test Verileri Kayıt Çalışma Sayfasıyla” eşleştiğinden emin olmak için test kalibrasyon doğrulama işlemini ayarlayın. Sonuçları uygun test kalibrasyonu doğrulama kriterleriyle eşleştirdiğinizden emin olun. Prob karışımı ekleme sırasında uygun olmayan renk değişikliği gözlenmesi a) Prob karışımının kontroller ve/veya örneklerle uygun olmayan şekilde karışması veya hatalı prob karışımı hacminin eklenmesi Hibridizasyon mikroplakasını 2 dakika daha sallayın. b) Numune, renk değişimini maskeleyen kan veya başka materyal içermektedir Tarif edilen renk değişikliği bu numunelerde beklenmez; test sonuçlarının olumsuz etkilenmemesi gerekir. Halen mor kalan örnekler varsa uygun prob karışımından 35 µl daha ekleyin ve 800 ± 100 devir/dk hızında 3 dakika sallayarak iyice karıştırın. Prob karışımı eklenmesi ve tekrar karıştırma sonrasında uygun renk değişimi olmaz ve numunede kan veya başka materyal varsa numuneyi tekrar test edin. Test, test kalibrasyonu doğrulamayı geçemez; kontroller veya örneklerde sinyal yok a) Prob karışımı probsuz hazırlanmıştır Prob karışımı hazırlama talimatı için “Reaktif hazırlama”, sayfa 21, kısmına bakınız. b) Hazırlama sırasında prob Probu ve prob karışımını pipetlerken tek karışımının RNaz ile kullanımlık pudrasız eldivenler giyin ve aerosol bariyeri pipet uçları kullanın. kontaminasyonu Prob karışımını steril kaplarda hazırlayın. 42 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Açıklama ve öneriler c) Prob karışımının hazırlanması sırasında yetersiz karıştırma Probu prob karışımına ekledikten sonra en az 5 saniye yüksek hızda iyice vorteksleyin. Görünür bir vorteks oluşmalıdır. d) “Protokol 3: Hibridizasyon ve hibrid yakalama” sırasında hatalı süre veya sıcaklık Numuneleri tekrar test edin. e) Doğru DR1 miktarını eklememe veya belirtilen süre boyunca inkübe etmeme 8 kanallı bir pipet kullanarak her mikroplaka kuyusuna 75 µl DR1 pipetleyin. 20–25ºC'de 30–35 dakika inkübe edin. f) 8 kanallı bir pipet kullanarak her mikroplaka kuyusuna 75 µl DR2 pipetleyin. 20–25ºC'de 15–30 dakika inkübe edin. Doğru DR2 miktarını eklememe veya belirtilen süre boyunca inkübe etmeme g) DML aleti arızalı Daha fazla talimat için uygun kullanıcı el kitabında bakım, servis ve sorun giderme kısımlarına başvurun veya QIAGEN Teknik Servisi ile irtibat kurun. Kontroller ve/veya örneklerde artmış RLU (≥200 RLU) test; test kalibrasyon doğrulama kriterlerini geçemeyebilir a) Hatalı DNR hacmi eklenmiş veya yetersiz karıştırma DNR eklemeden önce tekrarlayan pozitif displasman pipetinin doğru iletim yaptığını doğrulayın. Kalibre edilmiş pipetler şarttır. Her mikroplaka kuyusuna yarım hacim DNR ekleyin ve iyice karıştırın. Yalancı pozitif sonuçlardan kaçınmak için sıvının mikroplaka kuyusunun tüm iç yüzeyini yıkadığından emin olun. Kontroller DNR eklenmesinden sonra mora dönmelidir. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 43 Açıklama ve öneriler b) DML aletinde ışık sızıntısı Boş bir mikroplaka okuyarak DML aletinde bir arka alan okuması yapın (ham veri ölçümü). 50 RLU üzerinde bir ölçüm ışık sızıntısının olabileceğine işaret eder. Daha fazla talimat için uygun kullanıcı el kitabında bakım, servis ve sorun giderme kısımlarına başvurun veya QIAGEN Teknik Servisi ile irtibat kurun. c) DR2 veya negatif kontrollerin DR1 veya eksojen alkalen fosfatazla kontaminasyonu Bakınız “Ek A: Kontaminasyon Değerlendirme İşlemleri”, sayfa 62. d) Yıkama tamponunun kontaminasyonu Bakınız “Ek A: Kontaminasyon Değerlendirme İşlemleri”, sayfa 62. e) Automated Plate Washer'ın kontaminasyonu Bakınız “Ek A: Kontaminasyon Değerlendirme İşlemleri”, sayfa 62. f) Mikroplaka kuyularını yıkama tamponuyla 6 kez, her seferinde mikroplaka kuyularını taşırarak yıkayın veya Automated Plate Washer'ı kullanın. Yıkamadan sonra mikroplaka kuyularında görünür pembe sıvı kalmamalıdır. Testlerde kontaminasyon veya arızalar için Otomatik Plaka Yıkayıcı Kullanıcı El Kitabına başvurun. DR1 inkübasyonundan sonra yakalama mikroplaka kuyularının yetersiz yıkanması g) Negatif kontrollerin DR1 ile kontaminasyonu 44 Tüm çalışma yüzeylerinin temiz ve kuru olduğundan emin olun. DR1 kullanırken dikkatli olun. Aerosol oluşturmaktan kaçının. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Açıklama ve öneriler h) Yakalama mikroplakasının boşaltma ve dokunarak sıvı giderme sırasında kontaminasyonu Mikroplakayı daima yeni, temiz KimTowels kağıt havluları veya eşdeğer az tiftikli kağıt havlu üzerine dokunarak sıvıyı giderin. i) Hatalı dokunarak sıvı giderme kağıt havluları kullanılması Dokunarak sıvıyı gidermek için KimTowels kağıt havluları veya eşdeğeri az tiftikli kağıt havlular kullanın j) PC1 olarak PC2 materyali kullanılmış veya test PC1/NC1 oranı test doğrulamasını geçemez. Testi tekrarlayın ve uygun kontrollerin kullanıldığından emin olun. Yakalama mikroplakasını çapraz kontaminasyon olabileceğinden daha önce kullanılmış kağıt havlular üzerine dokunarak sıvısını gidermeyin. Düşük PC/NC oranı veya yüksek sayıda (>%20) düşük pozitif numune; test, test kalibrasyonu doğrulama kriterlerini geçemeyebilir a) Yetersiz örnek hazırlama Denatürasyon sırasında her örneğe doğru DNR hacmi eklediğinizden emin olun. Vortekslemeyle iyice karıştırın. Yalancı pozitif sonuçlardan kaçınmak için sıvının tüpün tüm iç yüzeyini yıkadığından emin olun. PreservCyt numuneleriyle örnek hazırlama sırasında örneğin iyice karıştırıldığından ve denatürasyon inkübasyonu öncesinde hücre peleti tekrar süspansiyonunun tam olduğundan emin olun. Ek bilgi için digene HC2 Sample Conversion Kiti kullanma talimatına başvurun. Örnekte koyu mora belirgin bir renk değişikliği olmalıdır. 65 ± 2ºC'de 45 ± 5 dakika inkübe edin. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 45 Açıklama ve öneriler b) Kontrollerin yetersiz denatürasyonu Su banyosunun sıcaklığının yeterli olduğundan ve su banyosunda tüm tüp hacmini batırmaya yeterli su olduğundan emin olun. Kontrollerin DNR eklenmesi sonrasında iyice karıştırıldığından emin olun. c) Prob karışımının yetersiz karıştırılması veya kontroller ve/veya örneklere yetersiz prob karışımı eklenmiş Prob karışımı hazırlama sırasında prob karışımını iyice karıştırın ve bir vorteksin görünür olduğundan emin olun. Prob karışımı doğru iletimden emin olunması için mikroplaka kuyularına bir tekrarlayan pozitif displasman pipeti veya çoklu kanallı pipetle eklenmelidir. Ek bilgi için bakınız “Reaktif hazırlama,” sayfa 21. 46 d) Kontroller ve/veya örneklere yetersiz prob karışımı hacmi eklenmesi Kontroller ve/veya örneklere prob karışımını eklemeden önce pipetin doğru iletim yaptığından emin olun. e) DR1 aktivitesi kaybı DR1'i belirtilen sıcaklıkta sakladığınızdan emin olun (bakınız “Reaktif Saklama ve Muamele”, sayfa 17). f) İnkübatör sallayıcının doğru çalıştığından ve kalibrasyon dahilinde olduğundan emin olun. Yetersiz DNA–RNA hibridleri yakalama g) Yetersiz yıkama Mikroplaka kuyularını yıkama tamponuyla 6 kez, her seferinde mikroplaka kuyularını taşırarak yıkayın veya Automated Plate Washer kullanın. h) Yıkama tamponunun kontaminasyonu Bakınız “Ek A: Kontaminasyon Değerlendirme İşlemleri”, sayfa 62. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Açıklama ve öneriler RLU değerleri yaklaşık aynı olan bir dizi pozitif örnek a) Yakalama mikroplaka kuyularının kontaminasyonu Tüm inkübasyonlar sırasında yakalama mikroplakasını örtün. Testi yaparken reaktiflerin ve yakalama mikroplakasının aerosol kontaminasyonuna maruz kalmasından kaçının. Testi yaparken pudrasız eldivenler giyin. b) DR2 Kontaminasyonu DR2'yi yakalama mikroplaka kuyularına pipetlerken DR2'yi kontamine etmediğinizden emin olun. DR2'nin aerosollerden kontaminasyonundan kaçının. c) Automated Plate Washer Arızası Testlerde kontaminasyon veya arızalar için Otomatik Plaka Yıkayıcı Kullanıcı El Kitabına başvurun. Kontrol replikatlarında Büyük CV a) Test yapılması sırasında hatalı pipetleme Pipetin doğru ilettiğinden emin olun. Kullanılan pipetleri rutin olarak kalibre edin. b) Test yapılması sırasında yetersiz karıştırma Özellikle denatürasyon sırasında ve prob karışımını ekledikten sonra olmak üzere tüm adımlarda iyice karıştırdığınızdan emin olun. c) Sıvının hibridizasyon mikroplaka kuyularından yakalama mikroplaka kuyularına tam olmayan transferi Hibridizasyon mikroplaka kuyularından yakalama mikroplaka kuyularına tam sıvı transferi olduğundan emin olun. d) Mikroplaka kuyularının uygun olmayan yıkanması Mikroplaka kuyularını yıkama tamponuyla 6 kez, her seferinde mikroplaka kuyularını taşırarak yıkayın veya Automated Plate Washer'ı kullanın. Yıkamadan sonra mikroplaka kuyularında görünür pembe sıvı kalmamalıdır. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 47 Açıklama ve öneriler e) Mikroplaka kuyularının DR1 ile kontaminasyonu Tüm çalışma yüzeylerinin temiz ve kuru olduğundan emin olun. DR1 kullanırken dikkatli olun. Aerosol oluşturmaktan kaçının. Bilinen negatif numunelerden elde edilen yalancı pozitif sonuçlar a) Yetersiz örnek hazırlama Her kontrol ve örneğe doğru DNR hacmi eklediğinizden emin olun. Vortekslemeyle iyice karıştırın. Yalancı pozitif sonuçlardan kaçınmak için sıvının tüpün tüm iç yüzeyini yıkadığından emin olun. PreservCyt numuneleriyle örnek hazırlama sırasında örneğin iyice karıştırıldığından ve denatürasyon inkübasyonu öncesinde hücre peleti tekrar süspansiyonunun tam olduğundan emin olun. Ek bilgi için digene HC2 Sample Conversion Kiti kullanma talimatına başvurun. Koyu mora belirgin bir renk değişikliği gözlenmelidir. 65 ± 2ºC'de 45 ± 5 dakika inkübe edin. b) Örneğin hibridizasyon mikroplaka kuyusuna aktarılması sırasında pipet ucunun denatüre olmamış materyallerle kontaminasyonu 48 Yetersiz karıştırma servikal numunelere endojen spesifik olmayan DNA–RNA hibridlerinin tam olmayan denatürasyonuyla sonuçlanabilir. Özellikler PreservCyt numunelerinde bu hibridlerin numune tüpü duvarlarında bulunması olasıdır. Bu denatüre olmamış hücresel materyali olası bulaşmasını önlemek için pipet ucunun örneğin hibridizasyon mikroplakası kuyusuna aktarılması sırasında numune tüpünün kenarlarına dokunmasına izin vermeyin. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Açıklama ve öneriler c) Mikroplaka kuyularının DR1 ile kontaminasyonu Mikroplaka kuyularını yıkama tamponuyla 6 kez, her seferinde mikroplaka kuyularını taşırarak yıkayın veya Automated Plate Washer'ı kullanın. Yıkamadan sonra mikroplaka kuyularında görünür pembe sıvı kalmamalıdır. d) Yakalama mikroplakasının boşaltma ve dokunarak sıvı giderme sırasında kontaminasyonu Mikroplakayı daima yeni, temiz KimTowels kağıt havluları veya eşdeğer az tiftikli kağıt havlu üzerine dokunarak sıvıyı giderin. e) Yakalama mikroplaka kuyularının uygun olmayan yıkanması Mikroplaka kuyularını yıkama tamponuyla 6 kez, her seferinde mikroplaka kuyularını taşırarak yıkayın veya Automated Plate Washer'ı kullanın. Yakalama mikroplakasını çapraz kontaminasyon olabileceğinden daha önce kullanılmış kağıt havlular üzerine dokunarak sıvısını gidermeyin. Yıkamadan sonra mikroplaka kuyularında görünür pembe sıvı kalmamalıdır. f) DR2 Kontaminasyonu Örneklere DR2 eklerken numunelerde çapraz kontaminasyon oluşturmadığınızdan emin olun. Bir kitin bir parçasını kullanıyorsunuz, o test için gerekli DR2 hacmini pipeti doldurmadan önce temiz, tek kullanımlık bir reaktif rezervuarına bölüntüleyin. Testin beklendiği şekilde çalışmasıyla artmış NC1 RLU değerleri (>150 RLU) a) DR2'nin belirlenmiş süre veya belirlenmiş sıcaklık aralığı dışında yapılmasıyla yakalama mikroplakası inkübasyonu Test sonuçları geçersizdir. Testi tekrarlayın ve yakalama mikroplakasının belirtilen sıcaklıkta uygun süreyle inkübe edildiğinden emin olun. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 49 Açıklama ve öneriler b) DR2 veya yıkama tamponunun alkalen fosfataz veya DR1 ile kontaminasyonu Bakınız “Ek A: Kontaminasyon Değerlendirme İşlemleri,” sayfa 62. Kalite Kontrol Test kalibrasyonu doğrulama Test kalibrasyonu doğrulama reaktifler, kalibratörler ve kalite kontrollerin doğru çalıştığından ve test CO'sunun doğru şekilde saptanmasını mümkün kıldığından emin olmak için yapılır. digene HPV Genotyping PS Testi her testle test kalibrasyonu gerektirir; bu nedenle her testin doğrulanması gerekir. Bu test kalibrasyonu doğrulama işleminin dahili kalite kontrol testinin yerini alması amaçlanmamıştır. Test kalibrasyonunun doğrulanması için kabul edilebilir aralıklar sadece QIAGEN tarafından onaylanmış DML aletleri için belirlenmiştir. Test belirlenmiş test kalibrasyonu doğrulama kriterlerini karşılamalıdır. Aşağıdaki kriterlerden herhangi biri geçersizse test sonuçları geçersizdir. Negatif Kontrol 1 NC1, HPV 16 prob karışımını kullanan her testte üç kopya olarak test edilmelidir. NC1 replikatlarının test kalibrasyonunu doğrulamak için şu adımları gerçekleştirin. 1. 3 NC1 replikatının ortalaması ve varyasyon katsayısını (CV) hesaplayın. Geçerli bir NC1 ortalaması ≥10 ve ≤185 RLU şeklindedir ve CV ≤%35'tir. Şu şekilde devam edin: NC1 için gereken test kalibrasyon doğrulama kriteri karşılanmazsa PC1 test kalibrasyonu doğrulamaya geçin. Gereken test kalibrasyonu doğrulama kriterleri NC1 için karşılanırsa bu işlemle devam edin. Not: CV hesaplama formülü şöyledir: (standart sapma/ortalama) x 100 = %CV 50 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 2. Önceden hesaplanmış ortalamadan en uzakta RLU değerine sahip NC1 replikatını bir dışarıda kalan olarak çıkarın. 3. Ortalama ve CV değerini kalan 2 NC1 replikatıyla hesaplayın. Ortalama ve CV, NC1 için gerekli test kalibrasyon doğrulama kriterlerini karşılarsa PC1 test kalibrasyonu doğrulamaya ilerleyin. NC1 için gerekli test kalibrasyonu doğrulama kriterleri karşılanmazsa test kalibrasyonu geçersizdir ve test tüm numuneler için tekrarlanmalıdır. Bu nedenle digene HPV Genotyping PS Testi sonuçlarını bildirmeyin. Pozitif Kontrol 1 PC1, HPV 16 prob karışımını kullanan her testte üç kopya olarak test edilmelidir. PC1 replikatlarının test kalibrasyonunu doğrulamak için şu adımları gerçekleştirin. 1. Ortalama ve CV değerini 3 PC1 replikatıyla hesaplayın. Geçerli bir PC1 CV ≤%25. Şu şekilde devam edin: PC1 için gereken test kalibrasyon doğrulama kriteri karşılanırsa PC1/NC1 ortalaması test kalibrasyonu doğrulamaya geçin. Gereken test kalibrasyonu doğrulama kriterleri NPC1 için karşılanmazsa bu işlemle devam edin. 2. Önceden hesaplanmış ortalamadan en uzakta RLU değerine sahip PC1 replikatını bir dışarıda kalan olarak çıkarın. 3. Ortalama ve CV değerini kalan 2 PC1 replikatıyla hesaplayın. CV, PC1 için gereken test kalibrasyon doğrulama kriterini karşılarsa PC1/NC1 ortalaması test kalibrasyonu doğrulamaya geçin. PC1 için gerekli test kalibrasyonu doğrulama kriterleri karşılanmazsa test kalibrasyonu geçersizdir ve test tüm numuneler için tekrarlanmalıdır. Bu nedenle digene HPV Genotyping PS Testi sonuçlarını bildirmeyin. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 51 Positif kontrol 1 ortalaması / negatif kontrol 1 ortalaması Önceden hesaplanmış PC1 ortalaması ve NC1 ortalamasını kullanarak PC1/NC1 oranını hesaplayın. Geçerli bir PC1/NC1 oranı ≥2,0 ve ≤15,0 şeklindedir. Şu şekilde devam edin: PC1/NC1 oranı için gereken test kalibrasyon doğrulama kriteri karşılanmışsa prob spesifik kalite kontroller için test kalibrasyonu doğrulamaya geçin. PC1/NC1 oranı için gereken test kalibrasyon doğrulama kriteri karşılanmamışsa test kalibrasyonu geçersizdir ve test tüm numuneler için tekrarlanmalıdır. Bu nedenle digene HPV Genotyping PS Testi sonuçlarını bildirmeyin. Prob spesifik kalite kontroller digene HPV Genotyping PS Testiyle kalite kontrol örnekleri sağlanmıştır ve her test yapıldığında dahili kalite kontrol için kullanılmaları gerekir. Sağlanan kalite kontroller klonlanmış HPV DNA hedefleridir ve vahşi tip HPV'den türetilmemiştir. Bu, NC1 ve PC1 için kullanılan materyal tipiyle aynıdır. Ulusal veya yerel düzenlemeler veya akreditasyon organizasyonlarının kılavuz ilkeleri veya gerekliliklerine göre ek kalite kontroller test edilebilir. Sağlanan kalite kontroller PreservCyt Solüsyonu işlenmesi için uygun bir kalite kontrol görevi görmez. Testin geçerli olabilmesi için her kalite kontrol RLU/CO değeri aşağıda Tablo 4'te belirtildiği gibi tanımlanmış kriterlere uymalıdır. Kalite kontrollerin herhangi biri bu aralıklar dahilinde değilse test geçersizdir ve tüm numuneler için tekrarlanmalıdır. Bu nedenle digene HPV Genotyping PS Testi sonuçlarını bildirmeyin. Tablo 4. Kalite kontrol testi geçerlilik kriterleri Kalite kontrol 52 Minimum (RLU/CO) Maksimum (RLU/CO) NC2 0,001 0,999 PC2 2,0 10,0 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Sınırlamalar digene HPV Genotyping PS Testi kullanarak HPV saptanması birden fazla HPV tipi ile enfeksiyon olasılığını ortadan kaldırmaz. Bu test sadece yüksek riskli HPV tip 16, 18 ve 45 saptar. Numunede diğer yüksek riskli ve düşük riskli HPV tipleri bulunabilir. %1,25'ten (h/h) fazla kan içeren numuneler yalancı negatif test sonucu verebilir. HPV enfeksiyonu yüksek dereceli servikal hastalık varlığının kesin bir göstergesi değildir ve ayrıca tüm durumlarda yüksek dereceli servikal hastalık veya kanser gelişeceği anlamına gelmez. Performans Özellikleri digene HPV Genotyping PS Testi ve doğrulanmış bir kantitatif PCR HPV genotipleme testi arasında anlaşma QIAGEN'de digene HPV Genotyping PS Testi ile HPV tip 16, 18 ve 45 tanımlanması açısından test sonuçlarının doğrulanmış bir qPCR testiyle karşılaştırıldığında anlaşmasını belirlemek üzere bir performans değerlendirmesi yapılmıştır. Rutin bir tarama popülasyonundan toplam 287 PreservCyt ve 290 STM arşivlenmiş servikal numunesi elde edilmiştir. digene HC2 High-Risk HPV DNA Testi sonucu her numune için çalışmaya katılmadan önce belirlenmiştir. digene HC2 High-Risk HPV DNA Testi sonuçları şöyledir: 238 pozitif STM numunesi 52 negatif STM numunesi 237 pozitif PreservCyt numunesi 50 negatif PreservCyt numunesi Her HPV tipi için (16, 18 ve 45), her numune ilgili HPV tipinin saptanması için hem digene HPV Genotyping PS Testi hem qPCR test yöntemi ile üç kopyalı olarak çalışılmış ve böylece her test yöntemi için toplam 1731 test sonucu elde edilmiştir. Uyumsuzların çözümlenmesi sonrasında, 11 uyumsuz sonuç kalmıştır (bakınız aşağıda Tablo 5). digene HPV Genotyping PS Testinin qPCR ile anlaşması %99,4 (1720/1731) ve %95 güven aralığı (GCI) %98,9–99,6 olmuştur. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 53 Tablo 5. digene HPV Genotyping PS Test sonucunun qPCR test sonucuyla sonuç anlaşması digene HPV Genotyping PS Testi sonucu qPCR test sonucu + – + 110 4 – 7 1610 Spesifik HPV genotiplerinin saptanmasında anlaşma digene HPV Genotyping PS Testinin qPCR testiyle test sonucu anlaşması HPV genotipi temelinde belirlenmiştir (bakınız aşağıda Tablo 6). Tablo 6. digene HPV Genotyping PS Test sonucunun qPCR HPV genotip test sonucuyla sonuç anlaşması Anlaşma (%) (n/N) Genotip %95 CI HPV 16 99,1 (572/577) 98,0–99,6 HPV 18 99,7 (575/577) 98,7–99,9 HPV 45 99,3 (573/577) 98,2–99,7 54 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Numune tipine bağlı olarak test sonuçlarında anlaşma digene HPV Genotyping PS Testinin qPCR testiyle test sonucu anlaşması numune tipi temelinde belirlenmiştir (bakınız aşağıda Tablo 7). Tablo 7. digene HPV Genotyping PS Test sonucunun qPCR numune tipi test sonucuyla sonuç anlaşması Anlaşma (%) (n/N) Numune tipi STM numuneleri %95 CI 99,8 (868/870) 99,2–99,9 PreservCyt numuneleri 99.0 (852/861) 98,0–99,4% Analitik özgüllük digene HPV Genotyping PS Testinde kullanılan 3 HPV prob karışımının (16, 18 ve 45) her biri ile test başına 1E+7 kopya konsantrasyonuyla klinik olmayan bir klonlanmış HPV plasmid DNA paneli test edilmiştir. Testler 3 HPV prob karışımı ile şu HPV plasmid DNA'lar arasında çapraz reaksiyon bulunmadığını belirlemiştir: Yüksek riskli HPV tipleri 16, 18, 26, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 66, 68, 73 ve 82 Düşük riskli HPV tipleri 1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 11, 13, 30, 34, 34, 40, 42, 43, 44, 67, 69, 70 ve 71 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 55 Tekrar Üretilebilirlik digene HPV Genotyping PS Testinin genel tekrar üretilebilirliği belirlenmiştir. QIAGEN tesislerinde 3 farklı laboratuvarda 3 farklı kullanıcının, testi 3 farklı kit lotu kullanarak yapmasıyla testler gerçekleştirilmiştir. Her kullanıcı aynı panel üyelerini üç kopya olarak minimum 5 gün boyunca test etmiştir. STM numunesi tekrar üretilebilirliği STM numunesi tekrar üretilebilirlik paneli test edilen her HPV tipi için (HPV 16, 18 ve 45) şu konsantrasyonlarda plasmid solüsyonlarından oluşmuştur: 0 pg/ml (negatif) 0,5 pg/ml (yüksek negatif) 1,5 pg/ml (düşük pozitif) 10 pg/ml (yüksek pozitif) Gözlenen test sonuçları beklenen test sonuçlarıyla %100 anlaşmıştır. STM tekrar üretilebilirlik testi sonuçları temelinde digene HPV Genotyping PS Testi STM numunelerinde yüksek ölçüde tekrar üretilebilir. PreservCyt numunesi tekrar üretilebilirliği PreservCyt numunesi paneli tekrar üretilebilirliği şu konsantrasyonlarda HPV 16 için pozitif SiHa hücrelerinden oluşmuştur: 0 hücre/test (negatif) 250–750 hücre/test (yüksek negatif) 1000–5000 hücre/test (düşük pozitif) >5000 hücre/test (yüksek pozitif) Gözlenen test sonuçları beklenen test sonuçlarıyla %95,3 (103/108) anlaşmıştır. PreservCyt numunesi tekrar üretilebilirlik testi sonuçları temelinde digene HPV Genotyping PS Testi PreservCyt numunelerinde yüksek ölçüde tekrar üretilebilir. 56 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı STM ve PreservCyt numuneleri için DNA geri alınması STM ve PreservCyt numuneleri HPV 16 DNA geri alınması için incelenmiştir. SiHa hücreleri STM ve PreservCyt Solüsyonuna şu konsantrasyonlarda eklenmiştir: 500 hücre/test (yüksek negatif) 2000 hücre/test (düşük pozitif) 5000 hücre/test (yüksek pozitif) Her numune tipi geçerli kullanma talimatında tanımlandığı şekilde ilgili örnek hazırlama ve denatürasyon işlemlerine göre işlenmiş ve HPV 16 prob karışımı kullanılarak digene HPV Genotyping PS Testi ile test edilmiştir. Sonuçlar insan karsinom hücrelerinden HPV 16 DNA geri alınmasının 2 ortam için eşdeğer olduğunu ve PreservCyt örnek hazırlamanın digene HPV Genotyping PS Testinin analitik hassasiyetini etkilemediğini göstermiştir. Çapraz reaktivite Çapraz reaktivite paneli Dişi anogenital kanalında sık olarak bulunan organizmaların bir paneli digene HPV Genotyping PS Testi ile çapraz reaktivite oluşup oluşmayacağını belirlemek üzere test edilmiştir. Tüm mikroorganizmalar 105 ve 107 organizma/ml konsantrasyonlarında test edilmiştir. Aşağıdaki organizmalar test edilmiş ve digene HPV Genotyping PS Testi ile çapraz reaksiyon göstermemiştir: Acinetobacter anitratus (ATCC 49139) Acinetobacter lwoffi (ATCC 17925) Bacteroides fragilis (ATCC 25285) Bacteroides melaninogenicus (ATCC 25845) Candida albicans (ATCC 10231) Chlamydia trachomatis (ATCC VR-878) Enterobacter cloacae (ATCC 13047) Escherichia coli HB101 (ATCC 33694) Escherichia coli (ATCC 25922) Fusobacterium nucleatum (ATCC 25586) digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 57 Gardnerella vaginalis (ATCC 49145) Haemophilus ducreyi (ATCC 700724) Klebsiella pneumonia (ATCC 13883) Lactobacillus acidophilus (ATCC 4356) Mobiluncus curtisii (ATCC 35241) Mobiluncus mulieris (ATCC 35243) Sekans analizi ile belirlendiği şekilde çapraz reaktivite digene HPV Genotyping PS Testi prob karışımlarında kullanılan oligonükleotidlerle herhangi bir örtüşen sekansın çapraz reaksiyon göstermeyeceğinden emin olmak için şu virüslerle bir sekans analizi (blast) yapılmıştır: Adenovirüs 2 Sitomegalovirüs Epstein-Barr Virüsü Hepatit B yüzey antijeni pozitif serum Herpes simplex 1 Herpes simplex 2 İnsan immünyetmezlik virüsü (HIV, RT DNA) pBR322 Simian virüsü tip 40 (SV40) Sekans analizi sonuçları digene HPV Genotyping PS Testi prob karışımlarının listedeki virüslerle çapraz hibridizasyon yapıp bir yalancı pozitif test sonucuna neden olma olasılığının düşük olduğunu göstermiştir. Kan ve diğer maddelerin STM numunelerine etkisi Kan ve diğer olası enterferans yapıcı tanımlanmış maddelerin etkisi digene HPV Genotyping PS Testinde değerlendirilmiştir. Tam kan, kontraseptif jöle, spermisid, nemlendirici, hemoroid anesteziği, vücut yağı, antifungal krem ve vajinal yağlayıcılar (servikal numunelerde sıklıkla bulunabilen ajanlar) servikal numunelerde bulunabilecek konsantrasyonlarda STM'ye eklenmiştir. Ajanların hiçbiriyle herhangi bir konsantrasyonda yalancı pozitif sonuç elde edilmemiştir. Ancak en düşük hedef giriş konsantrasyonu olan 2 pg/ml kan test edilirken yalancı negatif sonuçlar gözlenmiştir. 2 pg/ml hedef 58 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı konsantrasyonuyla 17,5 μl/ml (%1,75 h/h) değerine eşit veya üstünde kan konsantrasyonuyla saptama enterferansı gözlenmiştir. 12,5 μl/ml (%1,25 h/h) kan konsantrasyonuyla enterferans gözlenmemıştır. Test edilen diğer ajanların hiçbiriyle herhangi bir yalancı negatif sonuç gözlenmemıştır. Kan ve diğer maddelerin PreservCyt numunelerine etkisi Kan ve diğer olası enterferans yapıcı tanımlanmış maddelerin etkisi digene HPV Genotyping PS Testinde değerlendirilmiştir. Tam kan, kontraseptif jöle, spermisid, nemlendirici, hemoroid anesteziği, vücut yağı, antifungal krem ve vajinal yağlayıcılar (servikal numunelerde sıklıkla bulunabilen ajanlar) servikal numunelerde bulunabilecek konsantrasyonlarda PreservCyt Solüsyonuna eklenmiştir. Ajanların hiçbiriyle herhangi bir test edilen konsantrasyonda yalancı pozitif veya yalancı negatif sonuç elde edilmemiştir. Referanslar QIAGEN, QIAGEN ürünlerini kullanan bilimsel yayınların büyük ve güncel bir çevrimiçi veri tabanını tutmaktadır. Kapsamlı araştırma seçenekleri gereksinim duyduğunuz makaleleri basit bir anahtar kelime arama veya uygulama, araştırma alanı, başlık, vs. belirterek bulmanızı mümkün kılar. Tam referans listesi için www.qiagen. com/RefDB/search.asp adresindeki QIAGEN Referans Veri Tabanını ziyaret edin veya QIAGEN Teknik Servis ya da yerel distribütörünüzle irtibat kurun. Atıfta bulunulan referanslar 1. Broker, T. R. and Botchan, M. (1986) Papillomaviruses: retrospectives and prospectives. In: Botchan, M., Grodzicker, T., and Sharp, P., eds. DNA Tumor Viruses: Control of Gene Expression and Replication. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, p. 17-36. From the 1985 Cancer Cells Conference at Cold Spring Harbor. 2. Lorincz, A.T. and Reid, R. (1989) Association of human papillomavirus with gynecologic cancer. Curr. Opin. Oncol. 1, 123. 3. Jenson, A.B., Kurman, R.J., and Lancaster, W.D. (1984) Human papillomaviruses. In: Belshe, R.B. Textbook of Human Virology. Littleton, MA: PSG-Wright, p 951. 4. Becker, T.M., Stone, K.M., and Alexander, E.R. (1987) Genital human papillomavirus infection: a growing concern. Obstet. Gynecol. Clin. North Am. 14(2), 389. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 59 60 5. McCance, D.J., Walker, P.G., Dyson, J.L., Coleman, D.V., and Singer, A. (1983) Presence of human papillomavirus DNA sequences in cervical intraepithelial neoplasia. Br. Med. J. 287, 784. 6. Naghashfar, Z. et. al. (1985) Identification of genital tract papillomaviruses HPV-6 and HPV-16 in warts of the oral cavity. J. Med. Virol. 17, 313. 7. Gissmann, L., Wolnik, L., Ikenberg, H., Koldovsky, U., Schnurch, H.G., and zur Hausen, H. (1983) Human papillomavirus types 6 and 11 DNA sequences in genital and laryngeal papillomas and in some cervical cancers. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80, 560. 8. Munoz, N., Bosch, F.X., Shah, K.V., and Meheus, A., eds. (1992) IARC Scientific Publications no. 119: The Epidemiology of Cervical Cancer and Human Papillomavirus. Lyon, France: International Agency for Research on Cancer. 9. Kjaer, S.K., Frederiksen, K., Munk, C., and Iftner, T. (2010) Long-term absolute risk of cervical intraepithelial neoplasia grade 3 or worse following human papillomavirus infection: role of persistence. J. Natl. Cancer Inst. 102, 1478. 10. de Sanjose, S. et al. (2010) Human papillomavirus genotype attribution in invasive cervical cancer: a retrospective cross-sectional worldwide study. Lancet Oncol. 11, 1048. 11. Wright J.D. et al. (2005) Human papillomavirus type and tobacco use as predictors of survival in early stage cervical carcinoma. Gynecol. Oncol. 98(1), 84. 12. Centers for Disease Control (1987) Recommendations for prevention of HIV transmission in health-care settings. MMWR Morb. Mortal. Wkly. Rep. 36(Suppl 2), 3S. 13. Sehulster, L.M., Hollinger, F.B., Dreesman, G.R., and Melnick, J.L. (1981) Immunological and biophysical alteration of hepatitis B virus antigens by sodium hypochlorite disinfection. Appl. Environ. Microbiol. 42(5), 762 14. Martin, L.S., McDougal, J.S., and Loskoski, S.L. (1985) Disinfection and inactivation of the human T lymphotropic virus type III/lymphadenopathy-associated virus. J. Infect. Dis. 152(2), 400. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Semboller Bu kullanma talimatında şu semboller kullanılmıştır: Sembol Sembol tanımı < n > test için yeterli içerik İn vitro diagnostik tıbbi cihaz Katalog numarası Küresel Ticaret Parça Numarası Üretici Avrupa Topluluğunda yetkili temsilci Son kullanma tarihi Kullanma talimatına başvurun İrtibat Bilgisi Teknik yardım ve daha fazla bilgi için lütfen www.qiagen.com/Support adresindeki Teknik Destek Merkezimize gidin veya QIAGEN Teknik Servis Bölümlerinden ya da yerel distribütörlerden birini arayın (arka kapağa bakın veya www.qiagen.com adresini ziyaret edin). digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 61 Ek A: Kontaminasyon Değerlendirme İşlemleri Test beklendiği şekilde performans göstermezse, nedeni kontaminasyon olabilir. Kontaminasyonun bir olasılık olup olmadığını değerlendirmek üzere her reaktif için aşağıdaki değerlendirme işlemini yapın. Saptama Reaktifi 2 Notlar: DR2 kontaminasyonunu önlemek için tek kullanımlık, pudrasız eldivenler giyin ve pipet uçlarını herhangi bir çalışma yüzeyine dokundurmayın. DR2 ile çalışırken doğrudan güneş ışığında çalışmaktan kaçının. 1. Temiz bir yakalama mikroplakası kuyu stripi alın ve bir plaka çerçevesine yerleştirin. 2. Bölüntülenmiş, kalan veya orijinal DR2 flakonundan 75 µl miktarını bir yakalama mikroplakası kuyusuna pipetleyin. Not: Performansın optimum değerlendirilmesi için DR2'yi 3 kopya halinde test edin. 3. 20–25ºC'de 15 dakika inkübe edin. Doğrudan güneş ışığından kaçının. 4. Yakalama mikroplakasını bir DML aleti kullanarak ölçün. DR2 kontrolü <50 RLU olmalıdır. DR2 değerleri <50 RLU ise testi tekrarlamak için DR2 kullanılabilir. DR2 kontamineyse (>50 RLU), yeni bir kit alın ve testi tekrarlayın. Yıkama Aygıtı ve/veya su kaynağı 1. Temiz bir yakalama mikroplakası kuyu stripi alın ve bir plaka çerçevesine yerleştirin. 2. Kuyuları 1–4 olarak işaretleyin. 4 ayrı yakalama mikroplaka kuyusuna 75 µl DR2 pipetleyin. Kuyu 1, DR2 kontrolü görevi yapar. 3. Yıkama Şişesinden 10 µl yıkama tamponunu mikroplaka kuyusu 2'ye pipetleyin. 4. Yıkama tamponunun yıkayıcı tüpü içinden akmasını bekleyin. Tüpten 10 µl yıkama tamponunu yıkama mikroplakası kuyusu 3'e pipetleyin. 5. Yıkama tamponunu hazırlamak için kullanılan sudan bir bölüntü alın. 10 µl suyu yıkama mikroplakası kuyusu 4'e pipetleyin. 62 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 6. 20–25ºC'de 15 dakika inkübe edin. Doğrudan güneş ışığından kaçının. 7. Yakalama mikroplakasını bir DML aleti kullanarak ölçün. DR2 kontrolü (kuyu 1) <50 RLU olmalıdır. Kuyu 2, 3 ve 4'ten RLU'yu DR2 kontrol RLU'suyla karşılaştırın. Kuyu 2, 3 ve 4 için ayrı RLU değerleri DR2 kontrol RLU'sunu 50 RLU geçmemelidir. DR2 kontrolden 50 RLU üzerinde değerler kontaminasyona işaret eder. Yıkama Aygıtını temizleme ve bakımını yapma talimatı için bakınız “Yıkama tamponu”, sayfa 25. Automated Plate Washer 1. Temiz bir yakalama mikroplakası kuyu stripi alın ve bir plaka çerçevesine yerleştirin. 2. Kuyuları 1–5 olarak işaretleyin. 5 yakalama mikroplaka kuyusuna 75 µl DR2 pipetleyin. Kuyu 1, DR2 kontrolü görevi yapar. 3. Plaka Yıkayıcı Yıkama Şişesinden 10 µl yıkama tamponunu mikroplaka kuyusu 2'ye pipetleyin. 4. Plaka Yıkayıcı Durulama Şişesinden 10 µl yıkama tamponunu mikroplaka kuyusu 3'e pipetleyin. 5. Plaka Yıkayıcı tuş takımında “Prime” (Sıvı Geçir) tuşuna basıp Yıkama Tamponunun hatlardan akmasını bekleyin. Oluktan 10 µl yıkama tamponunu mikroplakası kuyusu 4'e pipetleyin. 6. Plaka Yıkayıcı tuş takımında “Rinse” (Durula) tuşuna basıp duruma sıvısının hatlardan akmasını bekleyin. Oluktan 10 µl yıkama tamponunu mikroplakası kuyusu 5'e pipetleyin. 7. Örtün ve 20–25ºC'de 15 dakika inkübe edin. Doğrudan güneş ışığından kaçının. 8. Yakalama mikroplakasını bir DML aleti kullanarak ölçün. DR2 kontrolü (kuyu 1) <50 RLU olmalıdır. Kuyu 2, 3 ve 4 ve 5'ten RLU'yu DR2 kontrol RLU'suyla karşılaştırın. Kuyu 2, 3, 4 ve 5 için ayrı RLU değerleri DR2 kontrol RLU'sunu 50 RLU geçmemelidir. Plaka Yıkayıcıdan, DR2 kontrolden 50 RLU üzerinde değerler kontaminasyona işaret eder. Dekontaminasyon işlemi için Otomatik Plaka Yıkayıcı Kullanıcı El Kitabına başvurun. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 63 64 Çevre sıcaklığı: °C Test Yeri: Kullanıcı Kimliği: digene HPV Genotyping PS Testi lot numarası: Test Tarihi: Ek B: Test Verileri Kaydetme Çalışma Sayfası digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı Sipariş Bilgisi Ürün İçindekiler digene HPV Genotyping PS Testi 96 reaksiyon için: Reaktifler, Tamponlar, 4 Kontrol ve Yakalama Mikroplakası Kat. no. 613615 Hybrid Capture 2 Modular System DML 2000 Mikroplaka luminometresi, 240 V 5000-1020 DML 3000 Mikroplaka luminometresi, 120V/240 V 5000-00031 LumiCheck Plate User Package DML 2000 veya DML 3000 ile kullanılmak üzere plaka ve yazılım 6000-5023 Rotary Shaker I Dönen sallayıcı, 240 V 6000-2240E Automated Plate Washer 96 kuyucuklu plaka yıkayıcı, 240 V 6000-00175 MST Vortexer 2 Çoklu örnekli tüp vorteksleyici, 240 V 6000-5022 Hybridization Microplates Saydam polistiren 96 kuyulu mikroplakalar (100) 6000-1203 Microplate Lids Saydam polistiren mikroplaka kapakları (100) 6000-5001 Extra-long Pipet Tips Pipet uçları, 6 kutu/çanta 5075-1011 Disposable Reagent Reservoirs 25 ml kapasiteli plastik reaktif saklama üniteleri (100) 5090-1010 Aksesuarlar digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 65 DuraSeal tube sealer film Mühürleyici film 6000-5003 Plate sealers Yapışkan plaka mühürleyiciler (100) 5070-1010 250 adede kadar PreservCyt numunesinde örnek dönüştürme için: Örnek Dönüştürme Tamponu, Örnek Taşıma Ortamı, Denatürasyon Reaktifi ve Gösterge Boyası 5127-1220 Örnek hazırlama digene HC2 Sample Conversion Kit Güncel lisanslama bilgisi ve ürüne spesifik red beyanları için ilgili QIAGEN kiti kullanma talimatı veya kullanıcı el kitabına bakınız. QIAGEN kiti kullanma talimatı ve kullanıcı el kitapları www.qiagen.com adresinde bulunmaktadır veya QIAGEN Teknik Servis ya da yerel distribütörünüzden istenebilir. 66 digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı ® ® ® TM Ticari markalar: QIAGEN , digene , Hybrid Capture , (QIAGEN); DuraSeal (Diversified Biotech); ® ® ® ® Eppendorf , Repeater (Eppendorf AG); KimTowels (Kimberly-Clark Corporation); Parafilm (BEMIS ® ® Company, Inc.); ThinPrep , PreservCyt (Hologic, Inc.). Sınırlı Lisans Sözleşmesi Bu ürünün kullanılması digene HPV Genotyping PS Testini herhangi bir satın alanın veya kullanıcısının şu şartları kabul ettiğini belirtir: 1. digene HPV Genotyping PS Testi sadece sağlanan kullanma talimatıyla uyumlu olarak ve digene HPV Genotyping PS Testinde bulunan bileşenlerle kullanılmak üzeredir. QIAGEN herhangi bir fikri mülkiyeti altında digene HPV Genotyping PS Testinin sağlanan bileşenlerini bu digene HPV Genotyping PS Testine dahil edilmemiş herhangi bir bileşenle, digene HPV Genotyping PS Testi kullanma talimatı ve www.qiagen.com adresinde bulunan ek protokollerde tanımlanan şekiller dışında kullanma veya birleştirme lisansı vermemektedir. 2. Açık olarak belirtilen lisanslar dışında QIAGEN bu digene HPV Genotyping PS Testi ve/veya kullanımının üçüncü tarafların haklarını ihlal etmediği konusunda garanti vermez. 3. digene HPV Genotyping PS Testi ve bileşenleri tek kullanım için lisanslanmıştır ve tekrar kullanılamaz, yenilenemez veya tekrar satılamaz. 4. QIAGEN açık olarak belirtilenler dışında açık veya zımni herhangi bir başka lisansı özellikle reddeder. 5. digene HPV Genotyping PS Testinin satın alıcısı ve kullanıcısı yukarıda yasaklanan herhangi bir eyleme neden olabilecek veya bunları kolaylaştırabilecek herhangi bir adım atmamayı veya başkasının atmasına izin vermemeyi kabul eder. QIAGEN bu Sınırlı Lisans Sözleşmesinin yasaklarını herhangi bir mahkemede yürürlüğe koyabilir ve digene HPV Genotyping PS Testi ve/veya bileşenleriyle ilişkili herhangi bir fikri mülkiyet hakkı veya bu Sınırlı Lisans Sözleşmesini yürürlüğe koymak için tüm araştırma ve mahkeme masraflarını avukat masrafları dahil olmak üzere geri alacaktır. Güncellenmiş lisans şartları için bakınız www.qiagen.com. © 2012 – 2015 QIAGEN, tüm hakları saklıdır. digene HPV Genotyping PS Testi Kullanma Talimatı 67 www.qiagen.com Australia [email protected] Austria [email protected] Belgium [email protected] Brazil [email protected] Canada [email protected] China [email protected] Denmark [email protected] Finland [email protected] France [email protected] Germany [email protected] Hong Kong [email protected] India [email protected] Ireland [email protected] Italy [email protected] Japan [email protected] Korea (South) [email protected] Luxembourg [email protected] Mexico [email protected] The Netherlands [email protected] Norway [email protected] Singapore [email protected] Sweden [email protected] Switzerland [email protected] UK [email protected] USA [email protected] Sample & Assay Technologies
Benzer belgeler
S15-Anormal Servikal Sitoloji Sonucu Olan Hastalarda Servikal
sonuçlanmamaktadır. HPV çoğunlukla geçici enfeksiyona neden olur. Kalıcı veya
persistan enfeksiyonlar da genellikle kansere sebep olmadan medikal tedavi ile
normale dönmektedir. HPV sadece serviks ...